中国水产科学
中國水產科學
중국수산과학
Journal of Fishery Sciences of China
2011年
6期
1392-1398
,共7页
王全乐%冀培丰%徐鹏%孙效文
王全樂%冀培豐%徐鵬%孫效文
왕전악%기배봉%서붕%손효문
Tcl%转座子%鲤%拷贝数%重复序列
Tcl%轉座子%鯉%拷貝數%重複序列
Tcl%전좌자%리%고패수%중복서렬
在鲤(Cyprinus carpio)基因组中鉴别出一个新的具有潜在转座活性的Tcl类转座子,并命名为CCTN转座子(Cyprinus carpio Transposon,CCTN).CCTN转座子全长l 611 bp,由两端约214 bp的反向重复序列(Inverted Repeat,IR)和中间不间断的996 bp的转座酶开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)组成.CCTN转座子推测的转座酶序列中存在完整的DD(34)E结构域,此结构域是Tel类转座酶作用的必需位点之一.采用实时荧光定量PCR评估CCTN转座子在鲤基因组中的拷贝数约为2.28×103,占全基因组的0.21％.分子系统学研究表明,CCTN转座子是一个新的鱼类Tcl类转座子,其与斑马鱼(Danio rerio)Tzf-28、大西洋鲑(Salmo salar)SALT1和鲽(Pleuronectes platessa)PPTN2等Tcl类转座子亲缘关系较近.
在鯉(Cyprinus carpio)基因組中鑒彆齣一箇新的具有潛在轉座活性的Tcl類轉座子,併命名為CCTN轉座子(Cyprinus carpio Transposon,CCTN).CCTN轉座子全長l 611 bp,由兩耑約214 bp的反嚮重複序列(Inverted Repeat,IR)和中間不間斷的996 bp的轉座酶開放閱讀框(Open Reading Frame,ORF)組成.CCTN轉座子推測的轉座酶序列中存在完整的DD(34)E結構域,此結構域是Tel類轉座酶作用的必需位點之一.採用實時熒光定量PCR評估CCTN轉座子在鯉基因組中的拷貝數約為2.28×103,佔全基因組的0.21％.分子繫統學研究錶明,CCTN轉座子是一箇新的魚類Tcl類轉座子,其與斑馬魚(Danio rerio)Tzf-28、大西洋鮭(Salmo salar)SALT1和鰈(Pleuronectes platessa)PPTN2等Tcl類轉座子親緣關繫較近.
재리(Cyprinus carpio)기인조중감별출일개신적구유잠재전좌활성적Tcl류전좌자,병명명위CCTN전좌자(Cyprinus carpio Transposon,CCTN).CCTN전좌자전장l 611 bp,유량단약214 bp적반향중복서렬(Inverted Repeat,IR)화중간불간단적996 bp적전좌매개방열독광(Open Reading Frame,ORF)조성.CCTN전좌자추측적전좌매서렬중존재완정적DD(34)E결구역,차결구역시Tel류전좌매작용적필수위점지일.채용실시형광정량PCR평고CCTN전좌자재리기인조중적고패수약위2.28×103,점전기인조적0.21％.분자계통학연구표명,CCTN전좌자시일개신적어류Tcl류전좌자,기여반마어(Danio rerio)Tzf-28、대서양해(Salmo salar)SALT1화접(Pleuronectes platessa)PPTN2등Tcl류전좌자친연관계교근.
