基础医学与临床
基礎醫學與臨床
기출의학여림상
BASIC MEDICAL SCIENCES AND CLINICS
2013年
11期
1391-1397
,共7页
庞希宁%李彩虹%施萍%王竟%刘晓玉%张涛%张殿宝%赵峰
龐希寧%李綵虹%施萍%王竟%劉曉玉%張濤%張殿寶%趙峰
방희저%리채홍%시평%왕경%류효옥%장도%장전보%조봉
表皮生长因子%人羊膜间充质干细胞%基因表达谱%测序%生物信息学
錶皮生長因子%人羊膜間充質榦細胞%基因錶達譜%測序%生物信息學
표피생장인자%인양막간충질간세포%기인표체보%측서%생물신식학
epidermal growth factor%human amnion mesenchymal stem cells%gene expression profile%sequencing%bioinformatics
目的 探讨表皮生长因子(EGF)对人羊膜间充质干细胞(hAMSCs)基因表达谱影响及分子机制.方法 采用基因表达谱测序(Illumina RNA-Seq)技术和生物信息学分析方法,对100 ng/mL EGF干预前后的hAMSCs基因表达测序比对,确定hAMSCs基因表达谱,RT-PCR检测进行验证.结果 筛选出差异表达基因104个(FDR≤0.001和|log2 Ratio|≥1),其中上调差异表达基因56个,下调差异表达基因48个；GO生物学过程富集分析26个生物学过程具有显著性差异(P≤0.05)；KEGG信号通路富集分析细胞因子与细胞因子相互作用信号通路具有显著性差异(Q≤0.05),RT-PCR检测验证与基因表达谱结果一致.结论 EGF干预hAMSCs引起基因表达谱的变化,显著差异表达的基因和信号通路可能在hAMSCs增殖和迁移及促进创伤修复过程中具有重要作用.
目的 探討錶皮生長因子(EGF)對人羊膜間充質榦細胞(hAMSCs)基因錶達譜影響及分子機製.方法 採用基因錶達譜測序(Illumina RNA-Seq)技術和生物信息學分析方法,對100 ng/mL EGF榦預前後的hAMSCs基因錶達測序比對,確定hAMSCs基因錶達譜,RT-PCR檢測進行驗證.結果 篩選齣差異錶達基因104箇(FDR≤0.001和|log2 Ratio|≥1),其中上調差異錶達基因56箇,下調差異錶達基因48箇；GO生物學過程富集分析26箇生物學過程具有顯著性差異(P≤0.05)；KEGG信號通路富集分析細胞因子與細胞因子相互作用信號通路具有顯著性差異(Q≤0.05),RT-PCR檢測驗證與基因錶達譜結果一緻.結論 EGF榦預hAMSCs引起基因錶達譜的變化,顯著差異錶達的基因和信號通路可能在hAMSCs增殖和遷移及促進創傷脩複過程中具有重要作用.
목적 탐토표피생장인자(EGF)대인양막간충질간세포(hAMSCs)기인표체보영향급분자궤제.방법 채용기인표체보측서(Illumina RNA-Seq)기술화생물신식학분석방법,대100 ng/mL EGF간예전후적hAMSCs기인표체측서비대,학정hAMSCs기인표체보,RT-PCR검측진행험증.결과 사선출차이표체기인104개(FDR≤0.001화|log2 Ratio|≥1),기중상조차이표체기인56개,하조차이표체기인48개；GO생물학과정부집분석26개생물학과정구유현저성차이(P≤0.05)；KEGG신호통로부집분석세포인자여세포인자상호작용신호통로구유현저성차이(Q≤0.05),RT-PCR검측험증여기인표체보결과일치.결론 EGF간예hAMSCs인기기인표체보적변화,현저차이표체적기인화신호통로가능재hAMSCs증식화천이급촉진창상수복과정중구유중요작용.
