江苏农业科学
江囌農業科學
강소농업과학
JIANGSU AGRICULTURAL SCIENCES
2013年
10期
33-36
,共4页
尚洁%赵海燕%朱武政
尚潔%趙海燕%硃武政
상길%조해연%주무정
枸杞%DFR基因%克隆%生物信息学分析
枸杞%DFR基因%剋隆%生物信息學分析
구기%DFR기인%극륭%생물신식학분석
二氢黄酮醇4-还原酶(DFR,1.1.1.219)是类黄酮代谢中花青素合成的一种主要调控酶,它依赖NADPH还原二氢黄酮醇为无色花色素。以枸杞为材料,利用序列同源原理和RT-PCR技术得到1条DFR基因,并对其进行生物信息学分析。结果表明,该基因的cDNA片段长为893 bp,编码297个氨基酸,蛋白分子量为33.94 ku,等电点为6.08。氨基酸序列和结构分析显示DFR基因具有典型的NAD( P)-binding Rossmann -fold结构域。 LyDFR蛋白很可能定位在细胞质。二级结构和三级结构进行预测,发现LyDFR蛋白中无规则卷曲114个,α螺旋和β折叠分别为124个和18个,延伸链41个。系统进化分析表明,枸杞LyDFR基因与马铃薯和番茄的DFR基因具有很高的同源性。这个基因已在GenBank上注册,基因序列登录号为KC795560。
二氫黃酮醇4-還原酶(DFR,1.1.1.219)是類黃酮代謝中花青素閤成的一種主要調控酶,它依賴NADPH還原二氫黃酮醇為無色花色素。以枸杞為材料,利用序列同源原理和RT-PCR技術得到1條DFR基因,併對其進行生物信息學分析。結果錶明,該基因的cDNA片段長為893 bp,編碼297箇氨基痠,蛋白分子量為33.94 ku,等電點為6.08。氨基痠序列和結構分析顯示DFR基因具有典型的NAD( P)-binding Rossmann -fold結構域。 LyDFR蛋白很可能定位在細胞質。二級結構和三級結構進行預測,髮現LyDFR蛋白中無規則捲麯114箇,α螺鏇和β摺疊分彆為124箇和18箇,延伸鏈41箇。繫統進化分析錶明,枸杞LyDFR基因與馬鈴藷和番茄的DFR基因具有很高的同源性。這箇基因已在GenBank上註冊,基因序列登錄號為KC795560。
이경황동순4-환원매(DFR,1.1.1.219)시류황동대사중화청소합성적일충주요조공매,타의뢰NADPH환원이경황동순위무색화색소。이구기위재료,이용서렬동원원리화RT-PCR기술득도1조DFR기인,병대기진행생물신식학분석。결과표명,해기인적cDNA편단장위893 bp,편마297개안기산,단백분자량위33.94 ku,등전점위6.08。안기산서렬화결구분석현시DFR기인구유전형적NAD( P)-binding Rossmann -fold결구역。 LyDFR단백흔가능정위재세포질。이급결구화삼급결구진행예측,발현LyDFR단백중무규칙권곡114개,α라선화β절첩분별위124개화18개,연신련41개。계통진화분석표명,구기LyDFR기인여마령서화번가적DFR기인구유흔고적동원성。저개기인이재GenBank상주책,기인서렬등록호위KC795560。