山西医科大学学报
山西醫科大學學報
산서의과대학학보
JOURNAL OF SHANXI MEDICAL UNIVERSITY
2013年
7期
530-534
,共5页
赵焕英%尚佳健%张琛%关蕊%杨颖
趙煥英%尚佳健%張琛%關蕊%楊穎
조환영%상가건%장침%관예%양영
口腔微生物群%16S rDNA%PCR-DGGE%克隆测序
口腔微生物群%16S rDNA%PCR-DGGE%剋隆測序
구강미생물군%16S rDNA%PCR-DGGE%극륭측서
oral microbiota%ribosomal 16S rDNA%denaturing gradient gel electrophoresis(DGGE)%clone sequencing
目的 比较16S rDNA克隆文库法与变性梯度凝胶电泳联合PCR法(PCR-DGGE)在口腔微生物多样性研究中的检测效率. 方法 采集6例逆行性牙髓炎患者根管细菌样本,提取细菌总DNA,采用细菌通用引物27F/1492R、HAD-1/2分别扩增16S rDNA的全长或V2-V3区域,PCR产物分别经琼脂糖凝胶电泳和DGGE分离,纯化目的条带后克隆测序.测序结果与数据库序列比对,鉴定细菌组成. 结果 琼脂糖电泳分离到16S rDNA约1.5 kb条带,每个样本检测到8-15种细菌;DGGE分离到V2-V3区约含6-12条位置不同的239 bp谱带,每个样本检测到6-12种细菌. 结论 与DGGE法相比,16S rDNA克隆文库法测得的菌群更全面,敏感性和特异性更高.
目的 比較16S rDNA剋隆文庫法與變性梯度凝膠電泳聯閤PCR法(PCR-DGGE)在口腔微生物多樣性研究中的檢測效率. 方法 採集6例逆行性牙髓炎患者根管細菌樣本,提取細菌總DNA,採用細菌通用引物27F/1492R、HAD-1/2分彆擴增16S rDNA的全長或V2-V3區域,PCR產物分彆經瓊脂糖凝膠電泳和DGGE分離,純化目的條帶後剋隆測序.測序結果與數據庫序列比對,鑒定細菌組成. 結果 瓊脂糖電泳分離到16S rDNA約1.5 kb條帶,每箇樣本檢測到8-15種細菌;DGGE分離到V2-V3區約含6-12條位置不同的239 bp譜帶,每箇樣本檢測到6-12種細菌. 結論 與DGGE法相比,16S rDNA剋隆文庫法測得的菌群更全麵,敏感性和特異性更高.
목적 비교16S rDNA극륭문고법여변성제도응효전영연합PCR법(PCR-DGGE)재구강미생물다양성연구중적검측효솔. 방법 채집6례역행성아수염환자근관세균양본,제취세균총DNA,채용세균통용인물27F/1492R、HAD-1/2분별확증16S rDNA적전장혹V2-V3구역,PCR산물분별경경지당응효전영화DGGE분리,순화목적조대후극륭측서.측서결과여수거고서렬비대,감정세균조성. 결과 경지당전영분리도16S rDNA약1.5 kb조대,매개양본검측도8-15충세균;DGGE분리도V2-V3구약함6-12조위치불동적239 bp보대,매개양본검측도6-12충세균. 결론 여DGGE법상비,16S rDNA극륭문고법측득적균군경전면,민감성화특이성경고.
