畜牧兽医学报
畜牧獸醫學報
축목수의학보
2013年
7期
1000-1007
,共8页
吴正常%王靖%朱世平%赵乔辉%刘璐%訾臣%吴圣龙%包文斌
吳正常%王靖%硃世平%趙喬輝%劉璐%訾臣%吳聖龍%包文斌
오정상%왕정%주세평%조교휘%류로%자신%오골룡%포문빈
猪%BPI基因%SNPs%生物信息学%蛋白结构和功能
豬%BPI基因%SNPs%生物信息學%蛋白結構和功能
저%BPI기인%SNPs%생물신식학%단백결구화공능
pig%BPI gene%SNPs%bioinformatics%protein structure and function
本试验以98头苏太猪为研究对象,检测BPI基因部分编码区的单核苷酸多态性(SNPs),并预测分析碱基突变对BPI蛋白结构和功能的影响.利用PCR-SSCP和PCR-RFLP结合测序的方法检测BPI基因外显子1、4和10的SNPs,运用生物信息学比较分析原蛋白和突变型蛋白的理化性质和结构.结果表明,以BPI基因cDNA序列作为参照,BPI外显子1、4和10存在6个SNPs,3个同义突变(c.24A＞G、c.54T＞C和c.522C＞T)和3个错义突变(c.433C＞T(Arg145Trp)、c.1060A＞G(Thr354Ala)和c.1151T＞G(Leu384Arg)).3种错义突变未改变BPI蛋白的理化性质、信号肽、跨膜区、糖基化位点以及二、三级结构,但是导致磷酸化位点的改变或存在其他潜在功能位点区域.Western blot试验发现,BPI蛋白的分子量为53 ku,苏太猪F18大肠杆菌抗性型猪的BPI蛋白表达量显著高于敏感型猪.猪BPI外显子4和10的碱基突变不同程度影响到蛋白功能,并可能对机体疾病的抗性/易感性产生影响.
本試驗以98頭囌太豬為研究對象,檢測BPI基因部分編碼區的單覈苷痠多態性(SNPs),併預測分析堿基突變對BPI蛋白結構和功能的影響.利用PCR-SSCP和PCR-RFLP結閤測序的方法檢測BPI基因外顯子1、4和10的SNPs,運用生物信息學比較分析原蛋白和突變型蛋白的理化性質和結構.結果錶明,以BPI基因cDNA序列作為參照,BPI外顯子1、4和10存在6箇SNPs,3箇同義突變(c.24A＞G、c.54T＞C和c.522C＞T)和3箇錯義突變(c.433C＞T(Arg145Trp)、c.1060A＞G(Thr354Ala)和c.1151T＞G(Leu384Arg)).3種錯義突變未改變BPI蛋白的理化性質、信號肽、跨膜區、糖基化位點以及二、三級結構,但是導緻燐痠化位點的改變或存在其他潛在功能位點區域.Western blot試驗髮現,BPI蛋白的分子量為53 ku,囌太豬F18大腸桿菌抗性型豬的BPI蛋白錶達量顯著高于敏感型豬.豬BPI外顯子4和10的堿基突變不同程度影響到蛋白功能,併可能對機體疾病的抗性/易感性產生影響.
본시험이98두소태저위연구대상,검측BPI기인부분편마구적단핵감산다태성(SNPs),병예측분석감기돌변대BPI단백결구화공능적영향.이용PCR-SSCP화PCR-RFLP결합측서적방법검측BPI기인외현자1、4화10적SNPs,운용생물신식학비교분석원단백화돌변형단백적이화성질화결구.결과표명,이BPI기인cDNA서렬작위삼조,BPI외현자1、4화10존재6개SNPs,3개동의돌변(c.24A＞G、c.54T＞C화c.522C＞T)화3개착의돌변(c.433C＞T(Arg145Trp)、c.1060A＞G(Thr354Ala)화c.1151T＞G(Leu384Arg)).3충착의돌변미개변BPI단백적이화성질、신호태、과막구、당기화위점이급이、삼급결구,단시도치린산화위점적개변혹존재기타잠재공능위점구역.Western blot시험발현,BPI단백적분자량위53 ku,소태저F18대장간균항성형저적BPI단백표체량현저고우민감형저.저BPI외현자4화10적감기돌변불동정도영향도단백공능,병가능대궤체질병적항성/역감성산생영향.
