南方医科大学学报
南方醫科大學學報
남방의과대학학보
JOURNAL OF SOUTHERN MEDICAL UNIVERSITY
2013年
7期
1017-1021
,共5页
张宝%黄克勇%郭劲松%吴娴波%李凌%朱利%万成松%赵卫
張寶%黃剋勇%郭勁鬆%吳嫻波%李凌%硃利%萬成鬆%趙衛
장보%황극용%곽경송%오한파%리릉%주리%만성송%조위
H7N9%禽流感%重组%生物信息学
H7N9%禽流感%重組%生物信息學
H7N9%금류감%중조%생물신식학
H7N9%avian influenza%recombination%bioinformatics
目的 通过序列分析揭示H7N9病毒的来源和重组产生模式.方法 收集H7N9序列,运用BLAST、MEGA5.0等生物信息学软件分析序列相似性、多序列比对、构建进化树,确定H7N9病毒各节段序列的亲缘序列,模拟H7N9重组产生方式.结果 系统进化树显示HA、NA、PB2和NS节段最近缘关系序列只有一个；而PB1、PA、NP和MP节段序列,分布于不同的两个分枝.通过组合分析亲缘序列,可以将目前流行的H7N9病毒分为5型:A、B、A/Shanghai/1/2013-H7N9、A/Pigeon/Shanghai/S 1069-H7N9和A/Zhejiang/HZ1/2013-H7N9.A型又可以分为A1和A2亚型.结论 通过对序列的组合分析,推测此次H7N9病毒流行至少由5个病毒经过4次重组产生,产生两个主要流行株A和B型.A1和A2亚型的出现是同一次重组过程中产生两株不同产物；A/Pigeon/Shanghai/S 1069-H7N9是A型H7N9病毒在流行期间与当地H9N2病毒的再一次重组产生.A/Zhejiang/HZ1/2013-H7N9是A2亚型和B型重组后产生的混合型.
目的 通過序列分析揭示H7N9病毒的來源和重組產生模式.方法 收集H7N9序列,運用BLAST、MEGA5.0等生物信息學軟件分析序列相似性、多序列比對、構建進化樹,確定H7N9病毒各節段序列的親緣序列,模擬H7N9重組產生方式.結果 繫統進化樹顯示HA、NA、PB2和NS節段最近緣關繫序列隻有一箇；而PB1、PA、NP和MP節段序列,分佈于不同的兩箇分枝.通過組閤分析親緣序列,可以將目前流行的H7N9病毒分為5型:A、B、A/Shanghai/1/2013-H7N9、A/Pigeon/Shanghai/S 1069-H7N9和A/Zhejiang/HZ1/2013-H7N9.A型又可以分為A1和A2亞型.結論 通過對序列的組閤分析,推測此次H7N9病毒流行至少由5箇病毒經過4次重組產生,產生兩箇主要流行株A和B型.A1和A2亞型的齣現是同一次重組過程中產生兩株不同產物；A/Pigeon/Shanghai/S 1069-H7N9是A型H7N9病毒在流行期間與噹地H9N2病毒的再一次重組產生.A/Zhejiang/HZ1/2013-H7N9是A2亞型和B型重組後產生的混閤型.
목적 통과서렬분석게시H7N9병독적래원화중조산생모식.방법 수집H7N9서렬,운용BLAST、MEGA5.0등생물신식학연건분석서렬상사성、다서렬비대、구건진화수,학정H7N9병독각절단서렬적친연서렬,모의H7N9중조산생방식.결과 계통진화수현시HA、NA、PB2화NS절단최근연관계서렬지유일개；이PB1、PA、NP화MP절단서렬,분포우불동적량개분지.통과조합분석친연서렬,가이장목전류행적H7N9병독분위5형:A、B、A/Shanghai/1/2013-H7N9、A/Pigeon/Shanghai/S 1069-H7N9화A/Zhejiang/HZ1/2013-H7N9.A형우가이분위A1화A2아형.결론 통과대서렬적조합분석,추측차차H7N9병독류행지소유5개병독경과4차중조산생,산생량개주요류행주A화B형.A1화A2아형적출현시동일차중조과정중산생량주불동산물；A/Pigeon/Shanghai/S 1069-H7N9시A형H7N9병독재류행기간여당지H9N2병독적재일차중조산생.A/Zhejiang/HZ1/2013-H7N9시A2아형화B형중조후산생적혼합형.
