国际检验医学杂志
國際檢驗醫學雜誌
국제검험의학잡지
INTERNATIONAL JOURNAL OF LABORATORY MEDICINE
2013年
13期
1725-1727
,共3页
生物信息学%检索%微RNAs
生物信息學%檢索%微RNAs
생물신식학%검색%미RNAs
目的 对miRBase等5种microRNA(miRNA)检索引擎的功能、特点等作一比较分析.方法 使用人、小鼠和大鼠3个种属及hsa-miR-92b等5种miRNA对miRBase等5种数据库的容量、检索功能特点、预测准确性等方面进行检索分析.结果 miRBase的种属收录量、单一种属中miRNA的收录量都是最多的.针对5种人源miRNA的靶基因检索,RNA22和TargetScan的数据返回量显著小于miRBase(P＜0.05),miRGen Targets的数据返回量显著多于miRBase(P＜0.05),其中miRGenTarget和miRBase对APP检索结果的重合率最高.结论 miRNAbase的综合检索能力和功能设置最为全面,对不同搜索引擎的功能和检索结果进行综合分析及合理利用将有助于研究效率的提高.
目的 對miRBase等5種microRNA(miRNA)檢索引擎的功能、特點等作一比較分析.方法 使用人、小鼠和大鼠3箇種屬及hsa-miR-92b等5種miRNA對miRBase等5種數據庫的容量、檢索功能特點、預測準確性等方麵進行檢索分析.結果 miRBase的種屬收錄量、單一種屬中miRNA的收錄量都是最多的.針對5種人源miRNA的靶基因檢索,RNA22和TargetScan的數據返迴量顯著小于miRBase(P＜0.05),miRGen Targets的數據返迴量顯著多于miRBase(P＜0.05),其中miRGenTarget和miRBase對APP檢索結果的重閤率最高.結論 miRNAbase的綜閤檢索能力和功能設置最為全麵,對不同搜索引擎的功能和檢索結果進行綜閤分析及閤理利用將有助于研究效率的提高.
목적 대miRBase등5충microRNA(miRNA)검색인경적공능、특점등작일비교분석.방법 사용인、소서화대서3개충속급hsa-miR-92b등5충miRNA대miRBase등5충수거고적용량、검색공능특점、예측준학성등방면진행검색분석.결과 miRBase적충속수록량、단일충속중miRNA적수록량도시최다적.침대5충인원miRNA적파기인검색,RNA22화TargetScan적수거반회량현저소우miRBase(P＜0.05),miRGen Targets적수거반회량현저다우miRBase(P＜0.05),기중miRGenTarget화miRBase대APP검색결과적중합솔최고.결론 miRNAbase적종합검색능력화공능설치최위전면,대불동수색인경적공능화검색결과진행종합분석급합리이용장유조우연구효솔적제고.
