热带作物学报
熱帶作物學報
열대작물학보
CHINESE JOURNAL OF TROPICAL CROPS
2013年
5期
875-883
,共9页
福州宦溪野生蕉(Musa spp.,AB group)%CHUP1%基因克隆%内含子分析%生物信息学
福州宦溪野生蕉(Musa spp.,AB group)%CHUP1%基因剋隆%內含子分析%生物信息學
복주환계야생초(Musa spp.,AB group)%CHUP1%기인극륭%내함자분석%생물신식학
Musa spp.(AB group) from Huanxi Town in Fuzhou%CHUP1%Gene cloning%Intron analysis%Bioinformatics
CHUP1(chloroplast unusual positioning 1)参与了叶绿体移动信号转导过程,对植物避免光伤害及提高光合效率方面具有重要作用,并且与植物抗寒性有密切关系.本研究以福州宦溪野生蕉(Musa spp.AB group)叶片为材料,采用同源克隆的方法,分离出CHUP1基因cDNA和DNA序列,GenBank登录号分别为JX123753、JX880084,命名为Mu-CHUP1.Mu-CHUP1 cDNA全长3232 bp,ORF 2931 bp,编码976个氨基酸.福州宦溪野生蕉Mu-CHUP1 cDNA序列与小果野蕉(M.acuminata,AA Group)全基因组测序中的CHUP1 cDNA序列的相似性为84.71％;福州宦溪野生蕉Mu-CHUP10RF的DNA序列含8个内含子、9个外显子,而小果野蕉全基因组测序中的CHUP1基因组DNA序列则有11个内含子、12个外显子,两者相差较大.生物信息学预测分析表明,Mu-CHUP1磷酸化位点多达62个,并且含有3个保守结构域,可能与其行使多样性的功能有关.
CHUP1(chloroplast unusual positioning 1)參與瞭葉綠體移動信號轉導過程,對植物避免光傷害及提高光閤效率方麵具有重要作用,併且與植物抗寒性有密切關繫.本研究以福州宦溪野生蕉(Musa spp.AB group)葉片為材料,採用同源剋隆的方法,分離齣CHUP1基因cDNA和DNA序列,GenBank登錄號分彆為JX123753、JX880084,命名為Mu-CHUP1.Mu-CHUP1 cDNA全長3232 bp,ORF 2931 bp,編碼976箇氨基痠.福州宦溪野生蕉Mu-CHUP1 cDNA序列與小果野蕉(M.acuminata,AA Group)全基因組測序中的CHUP1 cDNA序列的相似性為84.71％;福州宦溪野生蕉Mu-CHUP10RF的DNA序列含8箇內含子、9箇外顯子,而小果野蕉全基因組測序中的CHUP1基因組DNA序列則有11箇內含子、12箇外顯子,兩者相差較大.生物信息學預測分析錶明,Mu-CHUP1燐痠化位點多達62箇,併且含有3箇保守結構域,可能與其行使多樣性的功能有關.
CHUP1(chloroplast unusual positioning 1)삼여료협록체이동신호전도과정,대식물피면광상해급제고광합효솔방면구유중요작용,병차여식물항한성유밀절관계.본연구이복주환계야생초(Musa spp.AB group)협편위재료,채용동원극륭적방법,분리출CHUP1기인cDNA화DNA서렬,GenBank등록호분별위JX123753、JX880084,명명위Mu-CHUP1.Mu-CHUP1 cDNA전장3232 bp,ORF 2931 bp,편마976개안기산.복주환계야생초Mu-CHUP1 cDNA서렬여소과야초(M.acuminata,AA Group)전기인조측서중적CHUP1 cDNA서렬적상사성위84.71％;복주환계야생초Mu-CHUP10RF적DNA서렬함8개내함자、9개외현자,이소과야초전기인조측서중적CHUP1기인조DNA서렬칙유11개내함자、12개외현자,량자상차교대.생물신식학예측분석표명,Mu-CHUP1린산화위점다체62개,병차함유3개보수결구역,가능여기행사다양성적공능유관.
