CAJ | 학술논문

根据已构建苦瓜果实均一化文库中获得的1个与SAMDC基因相关的EST序列,采用3′RACE技术,克隆获得1个苦瓜SAMDC基因的cDNA全长序列,命名为McSAMDC(GenBank登录号为KC632099).生物信息分析结果表明,该cDNA全长l900bp,5′UTR和3′UTR分别长501、325bp.该cDNA序列存在3个开放读码框(微型tORF、上游读码框uORF和主读码框mORF),其中mORF长1077bp,编码358个氨基酸,预测分子量为39.31ku,含有酶原剪切位点结构域和蛋白快速降解有关的PEST二个保守结构域.二级结构分析显示,McSAMDC含有无规卷曲(45.53％)、α-螺旋(29.33％)、伸展链(19.83％)、β-转角(5.31％).序列分析结果表明,McSAMDC与拟南芥(CAA69073.1)、琴叶拟南芥(XP002882231.1)和雪里红(AAS45435.1)的氨基酸序列相似性分别达到69％、68％和68％.亚细胞定位结果表明,McSAMDC定位在细胞质中.荧光定量结果表明,McSAMDC在果实膨大期表达量最高,并随之迅速下降,并从成熟初期至完全成熟期该基因表达量逐渐增大.
근거이구건고과과실균일화문고중획득적1개여SAMDC기인상관적EST서렬,채용3′RACE기술,극륭획득1개고과SAMDC기인적cDNA전장서렬,명명위McSAMDC(GenBank등록호위KC632099).생물신식분석결과표명,해cDNA전장l900bp,5′UTR화3′UTR분별장501、325bp.해cDNA서렬존재3개개방독마광(미형tORF、상유독마광uORF화주독마광mORF),기중mORF장1077bp,편마358개안기산,예측분자량위39.31ku,함유매원전절위점결구역화단백쾌속강해유관적PEST이개보수결구역.이급결구분석현시,McSAMDC함유무규권곡(45.53％)、α-라선(29.33％)、신전련(19.83％)、β-전각(5.31％).서렬분석결과표명,McSAMDC여의남개(CAA69073.1)、금협의남개(XP002882231.1)화설리홍(AAS45435.1)적안기산서렬상사성분별체도69％、68％화68％.아세포정위결과표명,McSAMDC정위재세포질중.형광정량결과표명,McSAMDC재과실팽대기표체량최고,병수지신속하강,병종성숙초기지완전성숙기해기인표체량축점증대.