家畜生态学报
傢畜生態學報
가축생태학보
ACTA ECOLOGAE ANIMALIS DOMASTICI
2013年
7期
15-19,24
,共6页
徐苹%黄洁萍%王风巧%党瑞华%雷初朝
徐蘋%黃潔萍%王風巧%黨瑞華%雷初朝
서평%황길평%왕풍교%당서화%뢰초조
马%SLC36A1基因%多态性%SNP%PCR-RFLP
馬%SLC36A1基因%多態性%SNP%PCR-RFLP
마%SLC36A1기인%다태성%SNP%PCR-RFLP
horses%SLC36A1 gene%polymorphism%SNP%PCR-RFLP
控制马香槟毛色的CH (Champagne gene)基因家族包含4个候选基因(SLC36A1、SLC36A2、SLC36A3、SPARC),研究发现SLC36A1基因外显子2的突变是造成马香槟毛色的关键位点.为揭示中国马SLC36A1基因遗传多态性,本研究以玉树马和德保矮马共74个样本为研究对象,以马DNA池为模板扩增SLC36A1基因的10个外显子及部分内含子序列并进行测序分析.共发现马SLC36A1基因5个SNPs,分别位于内含子3(g.26699953 A>G,g.26699851G>C,g.26699850 G>C),外显子4(g.26699562 G>A)及外显子6(g.26697018 C>T).利用PCR-RFLP方法对74个家马样本进行基因分型,发现外显子6的SNP有基因型CC、CT;外显子4的SNP有基因型GG、GA;内含子3的g.26699850 G>C突变有基因型GG、GC;内含子3的另外2个SNPs(g.26699953 A>G,g.26699851 G>C)通过测序,发现有AA、AG、GG与GG、GC、CC基因型.所有5个马SNPs均为野生型占主要优势.由此界定了马SLC36A1基因有9种单倍型(H1-H9),其中H5是最主要的单倍型.德保矮马遗传多样度为0.4190,比玉树马(0.2228)高,表明德保矮马香槟毛色遗传多态性比玉树马更丰富.玉树马与德保矮马的平均单倍型多样度为0.3160,表明其香槟毛色遗传多态性相对较低.
控製馬香檳毛色的CH (Champagne gene)基因傢族包含4箇候選基因(SLC36A1、SLC36A2、SLC36A3、SPARC),研究髮現SLC36A1基因外顯子2的突變是造成馬香檳毛色的關鍵位點.為揭示中國馬SLC36A1基因遺傳多態性,本研究以玉樹馬和德保矮馬共74箇樣本為研究對象,以馬DNA池為模闆擴增SLC36A1基因的10箇外顯子及部分內含子序列併進行測序分析.共髮現馬SLC36A1基因5箇SNPs,分彆位于內含子3(g.26699953 A>G,g.26699851G>C,g.26699850 G>C),外顯子4(g.26699562 G>A)及外顯子6(g.26697018 C>T).利用PCR-RFLP方法對74箇傢馬樣本進行基因分型,髮現外顯子6的SNP有基因型CC、CT;外顯子4的SNP有基因型GG、GA;內含子3的g.26699850 G>C突變有基因型GG、GC;內含子3的另外2箇SNPs(g.26699953 A>G,g.26699851 G>C)通過測序,髮現有AA、AG、GG與GG、GC、CC基因型.所有5箇馬SNPs均為野生型佔主要優勢.由此界定瞭馬SLC36A1基因有9種單倍型(H1-H9),其中H5是最主要的單倍型.德保矮馬遺傳多樣度為0.4190,比玉樹馬(0.2228)高,錶明德保矮馬香檳毛色遺傳多態性比玉樹馬更豐富.玉樹馬與德保矮馬的平均單倍型多樣度為0.3160,錶明其香檳毛色遺傳多態性相對較低.
공제마향빈모색적CH (Champagne gene)기인가족포함4개후선기인(SLC36A1、SLC36A2、SLC36A3、SPARC),연구발현SLC36A1기인외현자2적돌변시조성마향빈모색적관건위점.위게시중국마SLC36A1기인유전다태성,본연구이옥수마화덕보왜마공74개양본위연구대상,이마DNA지위모판확증SLC36A1기인적10개외현자급부분내함자서렬병진행측서분석.공발현마SLC36A1기인5개SNPs,분별위우내함자3(g.26699953 A>G,g.26699851G>C,g.26699850 G>C),외현자4(g.26699562 G>A)급외현자6(g.26697018 C>T).이용PCR-RFLP방법대74개가마양본진행기인분형,발현외현자6적SNP유기인형CC、CT;외현자4적SNP유기인형GG、GA;내함자3적g.26699850 G>C돌변유기인형GG、GC;내함자3적령외2개SNPs(g.26699953 A>G,g.26699851 G>C)통과측서,발현유AA、AG、GG여GG、GC、CC기인형.소유5개마SNPs균위야생형점주요우세.유차계정료마SLC36A1기인유9충단배형(H1-H9),기중H5시최주요적단배형.덕보왜마유전다양도위0.4190,비옥수마(0.2228)고,표명덕보왜마향빈모색유전다태성비옥수마경봉부.옥수마여덕보왜마적평균단배형다양도위0.3160,표명기향빈모색유전다태성상대교저.