生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2013年
2期
153-157
,共5页
束永俊%张晶红%王明波%郭东林%王晓萍%郭长虹
束永俊%張晶紅%王明波%郭東林%王曉萍%郭長虹
속영준%장정홍%왕명파%곽동림%왕효평%곽장홍
小麦%长链非编码RNA%全长cDNA%微小RNA
小麥%長鏈非編碼RNA%全長cDNA%微小RNA
소맥%장련비편마RNA%전장cDNA%미소RNA
Triticum Aestivum%Long Non-coding RNA%Full Length cDNA%MicroRNA
生物体有部分基因被转录成RNA,但是不编码相应蛋白质,称为长链非编码RNA(IncRNA).它们参与基因的表观调控,这一过程对动物、植物的生长发育都有重要作用,但是,目前植物中发现和研究的IncRNA较少.为了研究lncRNA在植物中的功能,本研究建立了基于小麦全长cDNA的IncRNA识别程序.从6162条小麦全长cDNA中发现了231条IncRNAs,并从中鉴定出两个新miRNAs,这表明IncRNAs可以通过形成miRNAs前体基因形成其功能.此外,通过序列富集分析,我们从小麦IncRNAs中鉴定出三个保守的调控元件,结果显示小麦IncRNAs可能通过和其它蛋白质或DNA等分子作用,进而参与小麦生长、发育等过程的调控,这些结果对进一步研究植物体内的IncRNA的功能和作用机制具有重要意义.
生物體有部分基因被轉錄成RNA,但是不編碼相應蛋白質,稱為長鏈非編碼RNA(IncRNA).它們參與基因的錶觀調控,這一過程對動物、植物的生長髮育都有重要作用,但是,目前植物中髮現和研究的IncRNA較少.為瞭研究lncRNA在植物中的功能,本研究建立瞭基于小麥全長cDNA的IncRNA識彆程序.從6162條小麥全長cDNA中髮現瞭231條IncRNAs,併從中鑒定齣兩箇新miRNAs,這錶明IncRNAs可以通過形成miRNAs前體基因形成其功能.此外,通過序列富集分析,我們從小麥IncRNAs中鑒定齣三箇保守的調控元件,結果顯示小麥IncRNAs可能通過和其它蛋白質或DNA等分子作用,進而參與小麥生長、髮育等過程的調控,這些結果對進一步研究植物體內的IncRNA的功能和作用機製具有重要意義.
생물체유부분기인피전록성RNA,단시불편마상응단백질,칭위장련비편마RNA(IncRNA).타문삼여기인적표관조공,저일과정대동물、식물적생장발육도유중요작용,단시,목전식물중발현화연구적IncRNA교소.위료연구lncRNA재식물중적공능,본연구건립료기우소맥전장cDNA적IncRNA식별정서.종6162조소맥전장cDNA중발현료231조IncRNAs,병종중감정출량개신miRNAs,저표명IncRNAs가이통과형성miRNAs전체기인형성기공능.차외,통과서렬부집분석,아문종소맥IncRNAs중감정출삼개보수적조공원건,결과현시소맥IncRNAs가능통과화기타단백질혹DNA등분자작용,진이삼여소맥생장、발육등과정적조공,저사결과대진일보연구식물체내적IncRNA적공능화작용궤제구유중요의의.
