生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2013年
2期
150-152,160
,共4页
肖建平%丰继华%卢英%单秋甫
肖建平%豐繼華%盧英%單鞦甫
초건평%봉계화%로영%단추보
核小体%转录起始位点%预测准确率%进化印记
覈小體%轉錄起始位點%預測準確率%進化印記
핵소체%전록기시위점%예측준학솔%진화인기
Nucleosome%Transcriptional Start Sit%Predictive Accuracy Rates%Evolutionary Footprints
在利用核小体定位实验数据训练支持向量机(SVM)对任意酵母DNA序列的核小体形成能力进行预测的过程中,发现染色质结构对基因组DNA分子进化过程有着显著影响.我们观察到核小体DNA比连接DNA的平均预测准确率低15％,这种普遍存在的局部预测准确率差异性代表了酵母核小体定位的进化印迹(Evolutionary footprint),它揭示了核小体组织在基因组的整个进化过程中所具有的保守性.
在利用覈小體定位實驗數據訓練支持嚮量機(SVM)對任意酵母DNA序列的覈小體形成能力進行預測的過程中,髮現染色質結構對基因組DNA分子進化過程有著顯著影響.我們觀察到覈小體DNA比連接DNA的平均預測準確率低15％,這種普遍存在的跼部預測準確率差異性代錶瞭酵母覈小體定位的進化印跡(Evolutionary footprint),它揭示瞭覈小體組織在基因組的整箇進化過程中所具有的保守性.
재이용핵소체정위실험수거훈련지지향량궤(SVM)대임의효모DNA서렬적핵소체형성능력진행예측적과정중,발현염색질결구대기인조DNA분자진화과정유착현저영향.아문관찰도핵소체DNA비련접DNA적평균예측준학솔저15％,저충보편존재적국부예측준학솔차이성대표료효모핵소체정위적진화인적(Evolutionary footprint),타게시료핵소체조직재기인조적정개진화과정중소구유적보수성.
