生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2013年
2期
115-119
,共5页
沈玉琳%金能智%孙一桐%者建武%马尧
瀋玉琳%金能智%孫一桐%者建武%馬堯
침옥림%금능지%손일동%자건무%마요
GPGPU%序列比对%数学库函数
GPGPU%序列比對%數學庫函數
GPGPU%서렬비대%수학고함수
GPGPU%Sequence Alignment%Math Library Function
序列比对是生物信息学中最常用和最经典的研究手段.生物序列比对需要有强大计算能力的硬件支撑,而近年快速发展起来的GPGPU正好可堪此任.本文首先介绍GPGPU的发展过程,进而讲述GPGPU硬件设备与其编程环境,然后对GPGPU做科学计算时需要的数学库函数做一介绍,最后综述近年来国内外基于GPGPU的生物序列比对软件和相关研究工作,并总结和展望其辉煌前景.
序列比對是生物信息學中最常用和最經典的研究手段.生物序列比對需要有彊大計算能力的硬件支撐,而近年快速髮展起來的GPGPU正好可堪此任.本文首先介紹GPGPU的髮展過程,進而講述GPGPU硬件設備與其編程環境,然後對GPGPU做科學計算時需要的數學庫函數做一介紹,最後綜述近年來國內外基于GPGPU的生物序列比對軟件和相關研究工作,併總結和展望其輝煌前景.
서렬비대시생물신식학중최상용화최경전적연구수단.생물서렬비대수요유강대계산능력적경건지탱,이근년쾌속발전기래적GPGPU정호가감차임.본문수선개소GPGPU적발전과정,진이강술GPGPU경건설비여기편정배경,연후대GPGPU주과학계산시수요적수학고함수주일개소,최후종술근년래국내외기우GPGPU적생물서렬비대연건화상관연구공작,병총결화전망기휘황전경.
