生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2013年
2期
109-114
,共6页
绿色木霉%内切几丁质酶%序列分析
綠色木黴%內切幾丁質酶%序列分析
록색목매%내절궤정질매%서렬분석
T.viride%Endochitinase%Sequence Analysis
根据已克隆的内切几丁质酶基因序列的同源性比较,设计引物,采用PCR技术从绿色木霉基因组中分离出一个大小为1467bp的特异DNA片段,采用RT-PCR技术从绿色木霉总RNA中分离出大小约1 276bp的cDNA片段.序列对比后发现该内切几丁质酶DNA含有三个内含子,大小分别为52bp,69bp,64bp.同源性分析表明其全长cDNA序列和已经报道的内切几丁质酶序列的同源性高达95％以上,预测其编码蛋白的氨基酸序列含424个氨基酸残基,分子量为46 kDa,氨基酸序列分析表明该内切几丁质酶164-172位氨基酸是其活性中心,用同源建模法模拟其空间结构模型,为进一步研究其作用机制奠定了良好基础.
根據已剋隆的內切幾丁質酶基因序列的同源性比較,設計引物,採用PCR技術從綠色木黴基因組中分離齣一箇大小為1467bp的特異DNA片段,採用RT-PCR技術從綠色木黴總RNA中分離齣大小約1 276bp的cDNA片段.序列對比後髮現該內切幾丁質酶DNA含有三箇內含子,大小分彆為52bp,69bp,64bp.同源性分析錶明其全長cDNA序列和已經報道的內切幾丁質酶序列的同源性高達95％以上,預測其編碼蛋白的氨基痠序列含424箇氨基痠殘基,分子量為46 kDa,氨基痠序列分析錶明該內切幾丁質酶164-172位氨基痠是其活性中心,用同源建模法模擬其空間結構模型,為進一步研究其作用機製奠定瞭良好基礎.
근거이극륭적내절궤정질매기인서렬적동원성비교,설계인물,채용PCR기술종록색목매기인조중분리출일개대소위1467bp적특이DNA편단,채용RT-PCR기술종록색목매총RNA중분리출대소약1 276bp적cDNA편단.서렬대비후발현해내절궤정질매DNA함유삼개내함자,대소분별위52bp,69bp,64bp.동원성분석표명기전장cDNA서렬화이경보도적내절궤정질매서렬적동원성고체95％이상,예측기편마단백적안기산서렬함424개안기산잔기,분자량위46 kDa,안기산서렬분석표명해내절궤정질매164-172위안기산시기활성중심,용동원건모법모의기공간결구모형,위진일보연구기작용궤제전정료량호기출.
