生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2013年
2期
86-90
,共5页
蛋白质折叠%折叠速率%疏水值震荡%伪氨基酸组成%回归分析
蛋白質摺疊%摺疊速率%疏水值震盪%偽氨基痠組成%迴歸分析
단백질절첩%절첩속솔%소수치진탕%위안기산조성%회귀분석
Protein Folding%Folding Rates%Hydrophobic Value Vibration%Pseudo-amino Acid Composition%Regression Analysis
蛋白质折叠速率的正确预测对理解蛋白质的折叠机理非常重要.本文从伪氨基酸组成的方法出发,提出利用序列疏水值震荡的方法来提取蛋白质氨基酸的序列顺序信息,建立线性回归模进行折叠速率预测.该方法不需要蛋白质的任何二级结构、三级结构信息或结构类信息,可直接从序列对蛋白质折叠速率进行预测.对含有62个蛋白质的数据集,经过Jack-knife交互检验验证,相关系数达到0.804,表示折叠速率预测值与实验值有很好的相关性,说明了氨基酸序列信息对蛋白质折叠速率影响重要.同其他方法相比,本文的方法具有计算简单,输入参数少等特点.
蛋白質摺疊速率的正確預測對理解蛋白質的摺疊機理非常重要.本文從偽氨基痠組成的方法齣髮,提齣利用序列疏水值震盪的方法來提取蛋白質氨基痠的序列順序信息,建立線性迴歸模進行摺疊速率預測.該方法不需要蛋白質的任何二級結構、三級結構信息或結構類信息,可直接從序列對蛋白質摺疊速率進行預測.對含有62箇蛋白質的數據集,經過Jack-knife交互檢驗驗證,相關繫數達到0.804,錶示摺疊速率預測值與實驗值有很好的相關性,說明瞭氨基痠序列信息對蛋白質摺疊速率影響重要.同其他方法相比,本文的方法具有計算簡單,輸入參數少等特點.
단백질절첩속솔적정학예측대리해단백질적절첩궤리비상중요.본문종위안기산조성적방법출발,제출이용서렬소수치진탕적방법래제취단백질안기산적서렬순서신식,건립선성회귀모진행절첩속솔예측.해방법불수요단백질적임하이급결구、삼급결구신식혹결구류신식,가직접종서렬대단백질절첩속솔진행예측.대함유62개단백질적수거집,경과Jack-knife교호검험험증,상관계수체도0.804,표시절첩속솔예측치여실험치유흔호적상관성,설명료안기산서렬신식대단백질절첩속솔영향중요.동기타방법상비,본문적방법구유계산간단,수입삼수소등특점.
