CAJ | 학술논문

旨在缩小课题组前期全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS)结果区间范围,为下一步大规模群体验证提供有效候选基因.应用GWAS检验出的显著SNP标记构建单倍型,在大白猪×民猪F2设计资源群体内开展其与4个血常规指标(红细胞压积(Haematocrit,HCT)、血红蛋白(Hemoglobin,HGB)、平均红细胞血红蛋白量(Mean Corpuscular Hemoglobin,MCH)、平均红细胞体积(Mean Corpuscular Volume,MCV))和3个T细胞亚群指标(CD4+CD8-CD3+、CD4-CD8+CD3+和CD4+CD8-CD3+/CD4-CD8+CD3+)合计7个免疫性状指标的关联分析,寻找显著单倍型区段中的候选基因.分析结果表明:7号染色体上的3个单倍型区段均与T细胞亚群指标关联极显著,单倍型区段3(block7-3)与HGB及HCT关联极显著；8号染色体上3个单倍型区段均与MCH和MCV关联极显著,并由此定位5个候选基因:影响T细胞亚群指标的ABCF1和PPP1R10基因,影响HGB及HCT的GRM4基因,影响MCH及MCV的ALB和AFP基因.结合上述结果及基因功能,定位的5个基因可作为候选基因开展下一步研究.
지재축소과제조전기전기인조관련분석(Genome-wide Association Study,GWAS)결과구간범위,위하일보대규모군체험증제공유효후선기인.응용GWAS검험출적현저SNP표기구건단배형,재대백저×민저F2설계자원군체내개전기여4개혈상규지표(홍세포압적(Haematocrit,HCT)、혈홍단백(Hemoglobin,HGB)、평균홍세포혈홍단백량(Mean Corpuscular Hemoglobin,MCH)、평균홍세포체적(Mean Corpuscular Volume,MCV))화3개T세포아군지표(CD4+CD8-CD3+、CD4-CD8+CD3+화CD4+CD8-CD3+/CD4-CD8+CD3+)합계7개면역성상지표적관련분석,심조현저단배형구단중적후선기인.분석결과표명:7호염색체상적3개단배형구단균여T세포아군지표관련겁현저,단배형구단3(block7-3)여HGB급HCT관련겁현저；8호염색체상3개단배형구단균여MCH화MCV관련겁현저,병유차정위5개후선기인:영향T세포아군지표적ABCF1화PPP1R10기인,영향HGB급HCT적GRM4기인,영향MCH급MCV적ALB화AFP기인.결합상술결과급기인공능,정위적5개기인가작위후선기인개전하일보연구.