沈阳农业大学学报
瀋暘農業大學學報
침양농업대학학보
JOURNAL OF SHENYANG AGRICULTURAL UNIVERSITY
2013年
3期
349-352
,共4页
蛋白质结构预测%K均值聚类%关联规则
蛋白質結構預測%K均值聚類%關聯規則
단백질결구예측%K균치취류%관련규칙
protein structure prediction%K-means clustering%association rule
为了建立蛋白质一级结构与三维结构间的关联规则,以蛋白质数据库PDB为数据源,采用K均值聚类方法对蛋白质二级结构中α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲的疏水值、偶极矩、解离常数3种属性值序列进行分析.结果表明:80%的螺旋和85%的beta折叠都表现出了自身应有的规律,说明聚类分析方法在蛋白质三级结构预测研究中的合理性和有效性.
為瞭建立蛋白質一級結構與三維結構間的關聯規則,以蛋白質數據庫PDB為數據源,採用K均值聚類方法對蛋白質二級結構中α-螺鏇、β-摺疊和無規則捲麯的疏水值、偶極矩、解離常數3種屬性值序列進行分析.結果錶明:80%的螺鏇和85%的beta摺疊都錶現齣瞭自身應有的規律,說明聚類分析方法在蛋白質三級結構預測研究中的閤理性和有效性.
위료건립단백질일급결구여삼유결구간적관련규칙,이단백질수거고PDB위수거원,채용K균치취류방법대단백질이급결구중α-라선、β-절첩화무규칙권곡적소수치、우겁구、해리상수3충속성치서렬진행분석.결과표명:80%적라선화85%적beta절첩도표현출료자신응유적규률,설명취류분석방법재단백질삼급결구예측연구중적합이성화유효성.