军事医学
軍事醫學
군사의학
BULLETIN OF THE ACADEMY OF MILITARY MEDICAL SCIENCES
2013年
7期
517-520
,共4页
陆启轩%查磊%李宗城%陈临溪%李伍举%应晓敏
陸啟軒%查磊%李宗城%陳臨溪%李伍舉%應曉敏
륙계헌%사뢰%리종성%진림계%리오거%응효민
RNA-RNA相互作用%生物信息学%RNA,小核仁%核糖体RNA
RNA-RNA相互作用%生物信息學%RNA,小覈仁%覈糖體RNA
RNA-RNA상호작용%생물신식학%RNA,소핵인%핵당체RNA
目的 通过比较in vitro与in vivo的RNA-RNA相互作用(RNA-RNA interaction,RRI),探究通过in vitro RRI推测in vivo RRI的可靠性.方法 采用perl语言编写脚本分析酵母转录组水平in vitro RNA的二级结构信息,得到可能的in vitro RRI,再与酵母的in vivo 小核仁RNA(snoRNA)-rRNA相互作用进行比较.结果 发现in vitro snoRNA-rRNA相互作用与in vivo snoRNA-rRNA相互作用的重叠率仅为23.42%(26/111);而in vitro测定的snoRNA双链片段与in vivo测定的参与RRI的snoRNA片段重叠率为38.78%(19/49);in vitro测定的rRNA双链片段与in vivo测定的参与RRI的rRNA片段重叠率为80.70%(46/57).结论 in vitro和in vivo条件下snoRNA-rRNA 的相互作用差异很大,提示in vitro条件下测定的snoRNA-rRNA 的相互作用不能真实反映它们在in vivo的相互作用.
目的 通過比較in vitro與in vivo的RNA-RNA相互作用(RNA-RNA interaction,RRI),探究通過in vitro RRI推測in vivo RRI的可靠性.方法 採用perl語言編寫腳本分析酵母轉錄組水平in vitro RNA的二級結構信息,得到可能的in vitro RRI,再與酵母的in vivo 小覈仁RNA(snoRNA)-rRNA相互作用進行比較.結果 髮現in vitro snoRNA-rRNA相互作用與in vivo snoRNA-rRNA相互作用的重疊率僅為23.42%(26/111);而in vitro測定的snoRNA雙鏈片段與in vivo測定的參與RRI的snoRNA片段重疊率為38.78%(19/49);in vitro測定的rRNA雙鏈片段與in vivo測定的參與RRI的rRNA片段重疊率為80.70%(46/57).結論 in vitro和in vivo條件下snoRNA-rRNA 的相互作用差異很大,提示in vitro條件下測定的snoRNA-rRNA 的相互作用不能真實反映它們在in vivo的相互作用.
목적 통과비교in vitro여in vivo적RNA-RNA상호작용(RNA-RNA interaction,RRI),탐구통과in vitro RRI추측in vivo RRI적가고성.방법 채용perl어언편사각본분석효모전록조수평in vitro RNA적이급결구신식,득도가능적in vitro RRI,재여효모적in vivo 소핵인RNA(snoRNA)-rRNA상호작용진행비교.결과 발현in vitro snoRNA-rRNA상호작용여in vivo snoRNA-rRNA상호작용적중첩솔부위23.42%(26/111);이in vitro측정적snoRNA쌍련편단여in vivo측정적삼여RRI적snoRNA편단중첩솔위38.78%(19/49);in vitro측정적rRNA쌍련편단여in vivo측정적삼여RRI적rRNA편단중첩솔위80.70%(46/57).결론 in vitro화in vivo조건하snoRNA-rRNA 적상호작용차이흔대,제시in vitro조건하측정적snoRNA-rRNA 적상호작용불능진실반영타문재in vivo적상호작용.
