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KEJI YU QIYE
2013年
18期
327-329
,共3页
舌形贝%microRNA%腕足动物门%早寒武世%演化生物学
舌形貝%microRNA%腕足動物門%早寒武世%縯化生物學
설형패%microRNA%완족동물문%조한무세%연화생물학
腕足动物门(Brachiopoda)是最古老的Body plan之一,最早发现于早寒武世,繁盛于志留、泥盆二纪,其后延续至今[1-3]。多数腕足动物类群现已灭绝,舌形贝(Lingula Bruguire)是仅存的现生腕足动物之一。本文在Halanych等最新腕足动物分类标准的大前提下[3],以Lingula Bruguire为研究对象,通过microRNA谱的特征分析[4],探索原口动物与后口动物共同祖先(Protostome-deuterostome ancestor, PDA)的microRNA祖征(Plesiomorphy)状态[5]。本研究中,我们首先提取成体Lingula Bruguire的总RNA,然后以标准方法特异性提取其中的总MicroRNA,运用东南大学自主研发的AG-100高通量测序平台和ABI Solid 3.0测序系统,检测成体Lingula Bruguire的microRNA表达状态。在此基础之上,运用现代生物信息学手段,结合MiRBase现有数据,逐级分析现生触手冠类群(Lophophorata)、冠轮动物(Lophotrochozoa)和所有两侧对称动物(Bilateria)的microRNA分布关系,推测出PDA基因组可能拥有let-7、miR-10、miR-133、miR-184和miR-92等5个microRNA,为研究microRNA在真后生动物(Eumetazoa)亿万年演化历程中的相关变化提供研究基础。
腕足動物門(Brachiopoda)是最古老的Body plan之一,最早髮現于早寒武世,繁盛于誌留、泥盆二紀,其後延續至今[1-3]。多數腕足動物類群現已滅絕,舌形貝(Lingula Bruguire)是僅存的現生腕足動物之一。本文在Halanych等最新腕足動物分類標準的大前提下[3],以Lingula Bruguire為研究對象,通過microRNA譜的特徵分析[4],探索原口動物與後口動物共同祖先(Protostome-deuterostome ancestor, PDA)的microRNA祖徵(Plesiomorphy)狀態[5]。本研究中,我們首先提取成體Lingula Bruguire的總RNA,然後以標準方法特異性提取其中的總MicroRNA,運用東南大學自主研髮的AG-100高通量測序平檯和ABI Solid 3.0測序繫統,檢測成體Lingula Bruguire的microRNA錶達狀態。在此基礎之上,運用現代生物信息學手段,結閤MiRBase現有數據,逐級分析現生觸手冠類群(Lophophorata)、冠輪動物(Lophotrochozoa)和所有兩側對稱動物(Bilateria)的microRNA分佈關繫,推測齣PDA基因組可能擁有let-7、miR-10、miR-133、miR-184和miR-92等5箇microRNA,為研究microRNA在真後生動物(Eumetazoa)億萬年縯化歷程中的相關變化提供研究基礎。
완족동물문(Brachiopoda)시최고로적Body plan지일,최조발현우조한무세,번성우지류、니분이기,기후연속지금[1-3]。다수완족동물류군현이멸절,설형패(Lingula Bruguire)시부존적현생완족동물지일。본문재Halanych등최신완족동물분류표준적대전제하[3],이Lingula Bruguire위연구대상,통과microRNA보적특정분석[4],탐색원구동물여후구동물공동조선(Protostome-deuterostome ancestor, PDA)적microRNA조정(Plesiomorphy)상태[5]。본연구중,아문수선제취성체Lingula Bruguire적총RNA,연후이표준방법특이성제취기중적총MicroRNA,운용동남대학자주연발적AG-100고통량측서평태화ABI Solid 3.0측서계통,검측성체Lingula Bruguire적microRNA표체상태。재차기출지상,운용현대생물신식학수단,결합MiRBase현유수거,축급분석현생촉수관류군(Lophophorata)、관륜동물(Lophotrochozoa)화소유량측대칭동물(Bilateria)적microRNA분포관계,추측출PDA기인조가능옹유let-7、miR-10、miR-133、miR-184화miR-92등5개microRNA,위연구microRNA재진후생동물(Eumetazoa)억만년연화역정중적상관변화제공연구기출。