中南大学学报（自然科学版）
中南大學學報（自然科學版）
중남대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF CENTRAL SOUTH UNIVERSITY
2013年
3期
1024-1029
,共6页
关键蛋白质%蛋白质相互作用网络%基因表达%边聚集系数%皮尔逊相关系数
關鍵蛋白質%蛋白質相互作用網絡%基因錶達%邊聚集繫數%皮爾遜相關繫數
관건단백질%단백질상호작용망락%기인표체%변취집계수%피이손상관계수
提出一种新的融合了基因表达数据和PPI网络的拓扑特性来识别关键蛋白质的中心性测度PeC.对于网络中的每一条边,PeC首先计算该边的聚集系数和该边相连的2个基因(蛋白质)共表达的皮尔逊相关系数,并在此基础上进一步计算出该边的权值.网络中每个节点的PeC值即为其所连接的所有边的权值之和.基于酵母PPI网络上的实验结果表明,PeC明显优于其他8种中心性拓扑参数DC,BC,CC,SC,EC,IC,LAC和SoECC;特别地,在预测的蛋白质数量不大于总数量的10％的情况下,PeC的预测准确率相对于SC,CC和EC提高20％以上.
提齣一種新的融閤瞭基因錶達數據和PPI網絡的拓撲特性來識彆關鍵蛋白質的中心性測度PeC.對于網絡中的每一條邊,PeC首先計算該邊的聚集繫數和該邊相連的2箇基因(蛋白質)共錶達的皮爾遜相關繫數,併在此基礎上進一步計算齣該邊的權值.網絡中每箇節點的PeC值即為其所連接的所有邊的權值之和.基于酵母PPI網絡上的實驗結果錶明,PeC明顯優于其他8種中心性拓撲參數DC,BC,CC,SC,EC,IC,LAC和SoECC;特彆地,在預測的蛋白質數量不大于總數量的10％的情況下,PeC的預測準確率相對于SC,CC和EC提高20％以上.
제출일충신적융합료기인표체수거화PPI망락적탁복특성래식별관건단백질적중심성측도PeC.대우망락중적매일조변,PeC수선계산해변적취집계수화해변상련적2개기인(단백질)공표체적피이손상관계수,병재차기출상진일보계산출해변적권치.망락중매개절점적PeC치즉위기소련접적소유변적권치지화.기우효모PPI망락상적실험결과표명,PeC명현우우기타8충중심성탁복삼수DC,BC,CC,SC,EC,IC,LAC화SoECC;특별지,재예측적단백질수량불대우총수량적10％적정황하,PeC적예측준학솔상대우SC,CC화EC제고20％이상.
