宁夏医科大学学报
寧夏醫科大學學報
저하의과대학학보
JOURNAL OF NINGXIA MEDICAL COLLEGE
2013年
7期
778-781,785
,共5页
朱明星%杨桂茂%孙惠敏%张爱君%王秀青
硃明星%楊桂茂%孫惠敏%張愛君%王秀青
주명성%양계무%손혜민%장애군%왕수청
结核分枝杆菌%MPT64基因%扩增%生物信息学
結覈分枝桿菌%MPT64基因%擴增%生物信息學
결핵분지간균%MPT64기인%확증%생물신식학
目的 对结核分枝杆菌H37Rv (宁夏分离株NXT1024)MPT64基因进行生物信息学预测和分析,通过与结核杆菌标准株序列的比对,观察其变异情况.方法 提取结核分枝杆菌H37Rv(宁夏分离株NXT1024)基因组,以该基因组为模板,采用聚合酶链反应(PCR),从中扩增出MPT64基因,并测序,测序结果利用DNA star软件初步预测出该蛋白的分子特征、抗原性和二级结构等生物信息学信息.结果 MPT64基因全长为687bp,BLAST结果显示基因序列与GeneBank公布的标准株的基因序列的核苷酸同源性为93.6%,对该序列编码蛋白质的构象测试发现,该MPT64编码蛋白含有多个β转角结构,及多个明显的具有抗原活性的结构域和免疫优势辅助性T 淋巴细胞抗原位点.结论 以结核分枝杆菌宁夏分离株为模板成功扩增MPT64基因,该株与标准株的核苷酸同源性为93.6%.通过生物信息学分析获得了该蛋白的蛋白构象、抗原活性的结构域及T细胞表位等相关的生物学信息特征.
目的 對結覈分枝桿菌H37Rv (寧夏分離株NXT1024)MPT64基因進行生物信息學預測和分析,通過與結覈桿菌標準株序列的比對,觀察其變異情況.方法 提取結覈分枝桿菌H37Rv(寧夏分離株NXT1024)基因組,以該基因組為模闆,採用聚閤酶鏈反應(PCR),從中擴增齣MPT64基因,併測序,測序結果利用DNA star軟件初步預測齣該蛋白的分子特徵、抗原性和二級結構等生物信息學信息.結果 MPT64基因全長為687bp,BLAST結果顯示基因序列與GeneBank公佈的標準株的基因序列的覈苷痠同源性為93.6%,對該序列編碼蛋白質的構象測試髮現,該MPT64編碼蛋白含有多箇β轉角結構,及多箇明顯的具有抗原活性的結構域和免疫優勢輔助性T 淋巴細胞抗原位點.結論 以結覈分枝桿菌寧夏分離株為模闆成功擴增MPT64基因,該株與標準株的覈苷痠同源性為93.6%.通過生物信息學分析穫得瞭該蛋白的蛋白構象、抗原活性的結構域及T細胞錶位等相關的生物學信息特徵.
목적 대결핵분지간균H37Rv (저하분리주NXT1024)MPT64기인진행생물신식학예측화분석,통과여결핵간균표준주서렬적비대,관찰기변이정황.방법 제취결핵분지간균H37Rv(저하분리주NXT1024)기인조,이해기인조위모판,채용취합매련반응(PCR),종중확증출MPT64기인,병측서,측서결과이용DNA star연건초보예측출해단백적분자특정、항원성화이급결구등생물신식학신식.결과 MPT64기인전장위687bp,BLAST결과현시기인서렬여GeneBank공포적표준주적기인서렬적핵감산동원성위93.6%,대해서렬편마단백질적구상측시발현,해MPT64편마단백함유다개β전각결구,급다개명현적구유항원활성적결구역화면역우세보조성T 림파세포항원위점.결론 이결핵분지간균저하분리주위모판성공확증MPT64기인,해주여표준주적핵감산동원성위93.6%.통과생물신식학분석획득료해단백적단백구상、항원활성적결구역급T세포표위등상관적생물학신식특정.
