中国人兽共患病学报
中國人獸共患病學報
중국인수공환병학보
CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES
2013年
9期
829-835
,共7页
冯云%李灿委%章域震%杨卫红%张海林
馮雲%李燦委%章域震%楊衛紅%張海林
풍운%리찬위%장역진%양위홍%장해림
流行性乙型脑炎病毒%基因Ⅰ型%全基因组%同源性分析%系统进化分析
流行性乙型腦炎病毒%基因Ⅰ型%全基因組%同源性分析%繫統進化分析
류행성을형뇌염병독%기인Ⅰ형%전기인조%동원성분석%계통진화분석
Japanese encephalitis virus%genotype I%full-length genome%homology analysis%phylogenetic analysis
目的 分析中国首次分离的基因Ⅰ型流行性乙型脑炎病毒(JEV)全基因组的基因组特征.方法 设计JEV全基因组扩增引物,RT-PCR扩增片断,PCR产物直接测序,拼接后获得全基因组序列.采用生物学软件进行同源性和系统进化分析.结果 1977和1982年分离自云南蚊虫的M28和BN82215病毒株基因组全长分别为10 969 bp和10 970 bp,5′非编码区均含有96个核苷酸,3′非编码区含有573和574个核苷酸.它们的开放阅读框(ORF)都从97到10 396位,共10 299个核苷酸,编码3 433个氨基酸.M28和BN82215株与来自GenBank的5个基因型JEV株的全基因组核苷酸和氨基酸同源性分别为78.4%~96.3%和91.4%~99.6%,与近几年国内外基因Ⅰ型流行株的同源性最高,进化关系最接近,都属于基因Ⅰ型.这两株病毒与JEV疫苗株SA14-14-2相比,有56个氨基酸差异,其中E基因有11个氨基酸差异,但都不属抗原关键位点.结论 本研究阐明了中国首次分离的基因Ⅰ型JEV的全基因组分子特征,决定病毒抗原和毒力的E蛋白关键位点无明显变化.证实20世纪70和80年代云南省就有基因Ⅰ型JEV流行.
目的 分析中國首次分離的基因Ⅰ型流行性乙型腦炎病毒(JEV)全基因組的基因組特徵.方法 設計JEV全基因組擴增引物,RT-PCR擴增片斷,PCR產物直接測序,拼接後穫得全基因組序列.採用生物學軟件進行同源性和繫統進化分析.結果 1977和1982年分離自雲南蚊蟲的M28和BN82215病毒株基因組全長分彆為10 969 bp和10 970 bp,5′非編碼區均含有96箇覈苷痠,3′非編碼區含有573和574箇覈苷痠.它們的開放閱讀框(ORF)都從97到10 396位,共10 299箇覈苷痠,編碼3 433箇氨基痠.M28和BN82215株與來自GenBank的5箇基因型JEV株的全基因組覈苷痠和氨基痠同源性分彆為78.4%~96.3%和91.4%~99.6%,與近幾年國內外基因Ⅰ型流行株的同源性最高,進化關繫最接近,都屬于基因Ⅰ型.這兩株病毒與JEV疫苗株SA14-14-2相比,有56箇氨基痠差異,其中E基因有11箇氨基痠差異,但都不屬抗原關鍵位點.結論 本研究闡明瞭中國首次分離的基因Ⅰ型JEV的全基因組分子特徵,決定病毒抗原和毒力的E蛋白關鍵位點無明顯變化.證實20世紀70和80年代雲南省就有基因Ⅰ型JEV流行.
목적 분석중국수차분리적기인Ⅰ형류행성을형뇌염병독(JEV)전기인조적기인조특정.방법 설계JEV전기인조확증인물,RT-PCR확증편단,PCR산물직접측서,병접후획득전기인조서렬.채용생물학연건진행동원성화계통진화분석.결과 1977화1982년분리자운남문충적M28화BN82215병독주기인조전장분별위10 969 bp화10 970 bp,5′비편마구균함유96개핵감산,3′비편마구함유573화574개핵감산.타문적개방열독광(ORF)도종97도10 396위,공10 299개핵감산,편마3 433개안기산.M28화BN82215주여래자GenBank적5개기인형JEV주적전기인조핵감산화안기산동원성분별위78.4%~96.3%화91.4%~99.6%,여근궤년국내외기인Ⅰ형류행주적동원성최고,진화관계최접근,도속우기인Ⅰ형.저량주병독여JEV역묘주SA14-14-2상비,유56개안기산차이,기중E기인유11개안기산차이,단도불속항원관건위점.결론 본연구천명료중국수차분리적기인Ⅰ형JEV적전기인조분자특정,결정병독항원화독력적E단백관건위점무명현변화.증실20세기70화80년대운남성취유기인Ⅰ형JEV류행.