CAJ | 학술논문

本研究从NCBI的EST数据库中下载大叶藻EST序列共计10 659条,从中得到SSR位点共65个,SSR发生频率为1.7％,平均分布距离为21.7 kb.其中三核苷酸为优势重复类型,占49.2％,二核苷酸数量仅次于三核苷酸,占33.8％.基于65条含有SSR的EST序列,设计并合成了30对引物,其中26对引物的扩增产物单一,片段大小与预测的相近或较大.在由16个大叶藻个体组成的群体中,其中8对引物的扩增条带具有多态性.利用这8对引物对青岛汇泉湾大叶藻自然群体进行了遗传多样性分析,结果表明,8个SSR共检测出33个等位基因,平均每个SSR能检测出4.1个等位基因,多个遗传多样性参数表明,青岛汇泉湾大叶藻群体具有较高的遗传多样性(Ho=0.5382;He=0.577 6;I=0.560 7).本研究开发的EST-SSR标记,可进一步丰富大叶藻SSR标记信息,为大叶藻分子生态和群体遗传研究提供更多的标记选择.
본연구종NCBI적EST수거고중하재대협조EST서렬공계10 659조,종중득도SSR위점공65개,SSR발생빈솔위1.7％,평균분포거리위21.7 kb.기중삼핵감산위우세중복류형,점49.2％,이핵감산수량부차우삼핵감산,점33.8％.기우65조함유SSR적EST서렬,설계병합성료30대인물,기중26대인물적확증산물단일,편단대소여예측적상근혹교대.재유16개대협조개체조성적군체중,기중8대인물적확증조대구유다태성.이용저8대인물대청도회천만대협조자연군체진행료유전다양성분석,결과표명,8개SSR공검측출33개등위기인,평균매개SSR능검측출4.1개등위기인,다개유전다양성삼수표명,청도회천만대협조군체구유교고적유전다양성(Ho=0.5382;He=0.577 6;I=0.560 7).본연구개발적EST-SSR표기,가진일보봉부대협조SSR표기신식,위대협조분자생태화군체유전연구제공경다적표기선택.