深圳大学学报（理工版）
深圳大學學報（理工版）
심수대학학보（리공판）
JOURNAL OF SHENZHEN UNIVERSITY (SCIENCE & ENGINEERING)
2013年
5期
538-544
,共7页
王勇%李水明%何曼文%冯里茹
王勇%李水明%何曼文%馮裏茹
왕용%리수명%하만문%풍리여
蛋白质组学%数据库搜索%基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱%人工解析%亚胺离子
蛋白質組學%數據庫搜索%基質輔助激光解吸電離-串聯飛行時間質譜%人工解析%亞胺離子
단백질조학%수거고수색%기질보조격광해흡전리-천련비행시간질보%인공해석%아알리자
proteomics%database searching%matrix-assisted laser desorption time-of-flight mass spectrometry (MAL-DI-TOF/TOF)%manual explanation%immonium ions
为降低蛋白质鉴定的假阴性,利用标准蛋白和实际样品,探讨影响基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱数据利用度的原因.发现误差设置偏小、翻译后修饰、异常酶解和氨基酸突变等是导致蛋白质数据库检索不匹配目标肽段的主要原因.实验表明,典型情况下一级和二级质谱误差可设定在0.3Da.对未与数据库匹配的串联质谱进行亚胺离子辅助的人工解析发现,色氨酸双氧化、丝氨酸乙酰胺化和半胱氨酸丙酰胺化等不常见修饰,酪氨酸与苯丙氨酸、天冬氨酸与谷氨酸两两之间的突变和非特异性酶解等现象,该研究可提高质谱鉴定的数据利用度.
為降低蛋白質鑒定的假陰性,利用標準蛋白和實際樣品,探討影響基質輔助激光解吸電離-串聯飛行時間質譜數據利用度的原因.髮現誤差設置偏小、翻譯後脩飾、異常酶解和氨基痠突變等是導緻蛋白質數據庫檢索不匹配目標肽段的主要原因.實驗錶明,典型情況下一級和二級質譜誤差可設定在0.3Da.對未與數據庫匹配的串聯質譜進行亞胺離子輔助的人工解析髮現,色氨痠雙氧化、絲氨痠乙酰胺化和半胱氨痠丙酰胺化等不常見脩飾,酪氨痠與苯丙氨痠、天鼕氨痠與穀氨痠兩兩之間的突變和非特異性酶解等現象,該研究可提高質譜鑒定的數據利用度.
위강저단백질감정적가음성,이용표준단백화실제양품,탐토영향기질보조격광해흡전리-천련비행시간질보수거이용도적원인.발현오차설치편소、번역후수식、이상매해화안기산돌변등시도치단백질수거고검색불필배목표태단적주요원인.실험표명,전형정황하일급화이급질보오차가설정재0.3Da.대미여수거고필배적천련질보진행아알리자보조적인공해석발현,색안산쌍양화、사안산을선알화화반광안산병선알화등불상견수식,락안산여분병안산、천동안산여곡안산량량지간적돌변화비특이성매해등현상,해연구가제고질보감정적수거이용도.
