软件导刊
軟件導刊
연건도간
SOFT WARE GUIDE
2013年
8期
29-32,33
,共5页
孙路%吕强%徐维维%权丽君
孫路%呂彊%徐維維%權麗君
손로%려강%서유유%권려군
蛋白质%loop区域闭合%数值方法 ,循环坐标下降法%雅可比矩阵
蛋白質%loop區域閉閤%數值方法 ,循環坐標下降法%雅可比矩陣
단백질%loop구역폐합%수치방법 ,순배좌표하강법%아가비구진
Protein%Loop Region Closure%Numerical Method%Cyclic Coordinate Descent%Jacobian Matrix
针对蛋白质loop区域的闭合问题，比较分析了两种来源于机器人学的数值方法---循环坐标下降法（CCD）和雅可比矩阵方法，进行了实现并设计实验。在计算时间和闭合效率方面循环坐标下降法要明显优于雅可比矩阵方法，而雅可比矩阵方法则可以较平均地改变每一个二面角值。
針對蛋白質loop區域的閉閤問題，比較分析瞭兩種來源于機器人學的數值方法---循環坐標下降法（CCD）和雅可比矩陣方法，進行瞭實現併設計實驗。在計算時間和閉閤效率方麵循環坐標下降法要明顯優于雅可比矩陣方法，而雅可比矩陣方法則可以較平均地改變每一箇二麵角值。
침대단백질loop구역적폐합문제，비교분석료량충래원우궤기인학적수치방법---순배좌표하강법（CCD）화아가비구진방법，진행료실현병설계실험。재계산시간화폐합효솔방면순배좌표하강법요명현우우아가비구진방법，이아가비구진방법칙가이교평균지개변매일개이면각치。
To address the protein loop closure problem ,this paper realized and designed the experiments to analyse and compare two numerical methods inspired by robotics-Cyclic Coordinate Descent (CCD) and Jacobian matrix method .In terms of computing time and closure efficiency ,CCD performs better than Jacobian matrix method ,while Jacobian matrix method is able to modify each dihedral angle in a more balanced way .
