南京林业大学学报(自然科学版)
南京林業大學學報(自然科學版)
남경임업대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF NANJING FORESTRY UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE EDITION)
2014年
4期
29-33
,共5页
冯思思%王建新%庞晓明%邬荣领
馮思思%王建新%龐曉明%鄔榮領
풍사사%왕건신%방효명%오영령
同源四倍体%连锁不平衡%统计模型%最大期望算法
同源四倍體%連鎖不平衡%統計模型%最大期望算法
동원사배체%련쇄불평형%통계모형%최대기망산법
autotetraploid%linkage disequilibrium%statistical model%expectation-maximization algorithm
半数以上的被子植物是多倍体或在其进化史上出现过多倍体现象,连锁不平衡分析是研究自然群体遣传结构、分化及多样性的重要工具,但这一方法目前仅适用于二倍体自然群体.笔者根据同源四倍体减数分裂的特点推导出计算分子标记间连锁不平衡的统计模型,利用基因频率和基因型频率的关系,以计算机模拟试验验证了模型的有效性,并给出了模型的适用条件,即样本数量为200时,采用该模型估算的平均值可以满足分析要求.
半數以上的被子植物是多倍體或在其進化史上齣現過多倍體現象,連鎖不平衡分析是研究自然群體遣傳結構、分化及多樣性的重要工具,但這一方法目前僅適用于二倍體自然群體.筆者根據同源四倍體減數分裂的特點推導齣計算分子標記間連鎖不平衡的統計模型,利用基因頻率和基因型頻率的關繫,以計算機模擬試驗驗證瞭模型的有效性,併給齣瞭模型的適用條件,即樣本數量為200時,採用該模型估算的平均值可以滿足分析要求.
반수이상적피자식물시다배체혹재기진화사상출현과다배체현상,련쇄불평형분석시연구자연군체견전결구、분화급다양성적중요공구,단저일방법목전부괄용우이배체자연군체.필자근거동원사배체감수분렬적특점추도출계산분자표기간련쇄불평형적통계모형,이용기인빈솔화기인형빈솔적관계,이계산궤모의시험험증료모형적유효성,병급출료모형적괄용조건,즉양본수량위200시,채용해모형고산적평균치가이만족분석요구.