南京林业大学学报（自然科学版）
南京林業大學學報（自然科學版）
남경임업대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF NANJING FORESTRY UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE EDITION)
2014年
4期
23-28
,共6页
龙翔宇%何斌%曹冰%梁启福%方永军%阳江华%唐朝荣
龍翔宇%何斌%曹冰%樑啟福%方永軍%暘江華%唐朝榮
룡상우%하빈%조빙%량계복%방영군%양강화%당조영
橡胶树%HbF2KP%基因克隆%基因表达%生物信息学
橡膠樹%HbF2KP%基因剋隆%基因錶達%生物信息學
상효수%HbF2KP%기인극륭%기인표체%생물신식학
Hevea brasiliensis%HbF2KP%gene cloning%gene expression%bioinformatics analysis
根据拟南芥、蓖麻及杨树果糖-6-磷酸,2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶基因(F2KP)的核苷酸序列,使用橡胶树胶乳转录组数据库拼接到1条1 228 bp的核苷酸序列,通过两次RACE-PCR获得了橡胶树长2 629 bp的F2KP基因cDNA序列,命名为HbF2KP.ORF Finder软件分析结果显示,该序列含有211 bp的5'端非编码区,173 bp的3'端非编码区,以及长度为2 244 bp的开放阅读框(ORF).氨基酸同源性分析发现,该蛋白含有保守的激酶和酯酶结构域,属于具有双功能的果糖-6-磷酸,2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶.生物信息学分析显示,HbF2KP蛋白无导肽酶切位点,不具有跨膜结构域且属于亲水蛋白,推测该蛋白可能在细胞质中发挥作用.实时荧光定量PCR分析表明,HbF2KP基因在光合组织及非光合组织中均有表达.对非光合库组织胶乳(产胶细胞的细胞质)中的表达模式进行分析,结果显示该基因表达受割胶、伤害处理及死皮胁迫调控,推测其在橡胶树胶乳糖代谢中发挥重要的调控作用,参与橡胶烃的生物合成调控及死皮胁迫应答.此外,HbF2KP表达受部分植物激素或激素类似物如乙烯利(ET)、植物生长素(2,4-D)、脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)及赤霉素(GA)的调控,但调控作用不明显.
根據擬南芥、蓖痳及楊樹果糖-6-燐痠,2-激酶/果糖-2,6-二燐痠酶基因(F2KP)的覈苷痠序列,使用橡膠樹膠乳轉錄組數據庫拼接到1條1 228 bp的覈苷痠序列,通過兩次RACE-PCR穫得瞭橡膠樹長2 629 bp的F2KP基因cDNA序列,命名為HbF2KP.ORF Finder軟件分析結果顯示,該序列含有211 bp的5'耑非編碼區,173 bp的3'耑非編碼區,以及長度為2 244 bp的開放閱讀框(ORF).氨基痠同源性分析髮現,該蛋白含有保守的激酶和酯酶結構域,屬于具有雙功能的果糖-6-燐痠,2-激酶/果糖-2,6-二燐痠酶.生物信息學分析顯示,HbF2KP蛋白無導肽酶切位點,不具有跨膜結構域且屬于親水蛋白,推測該蛋白可能在細胞質中髮揮作用.實時熒光定量PCR分析錶明,HbF2KP基因在光閤組織及非光閤組織中均有錶達.對非光閤庫組織膠乳(產膠細胞的細胞質)中的錶達模式進行分析,結果顯示該基因錶達受割膠、傷害處理及死皮脅迫調控,推測其在橡膠樹膠乳糖代謝中髮揮重要的調控作用,參與橡膠烴的生物閤成調控及死皮脅迫應答.此外,HbF2KP錶達受部分植物激素或激素類似物如乙烯利(ET)、植物生長素(2,4-D)、脫落痠(ABA)、水楊痠(SA)及赤黴素(GA)的調控,但調控作用不明顯.
근거의남개、비마급양수과당-6-린산,2-격매/과당-2,6-이린산매기인(F2KP)적핵감산서렬,사용상효수효유전록조수거고병접도1조1 228 bp적핵감산서렬,통과량차RACE-PCR획득료상효수장2 629 bp적F2KP기인cDNA서렬,명명위HbF2KP.ORF Finder연건분석결과현시,해서렬함유211 bp적5'단비편마구,173 bp적3'단비편마구,이급장도위2 244 bp적개방열독광(ORF).안기산동원성분석발현,해단백함유보수적격매화지매결구역,속우구유쌍공능적과당-6-린산,2-격매/과당-2,6-이린산매.생물신식학분석현시,HbF2KP단백무도태매절위점,불구유과막결구역차속우친수단백,추측해단백가능재세포질중발휘작용.실시형광정량PCR분석표명,HbF2KP기인재광합조직급비광합조직중균유표체.대비광합고조직효유(산효세포적세포질)중적표체모식진행분석,결과현시해기인표체수할효、상해처리급사피협박조공,추측기재상효수효유당대사중발휘중요적조공작용,삼여상효경적생물합성조공급사피협박응답.차외,HbF2KP표체수부분식물격소혹격소유사물여을희리(ET)、식물생장소(2,4-D)、탈락산(ABA)、수양산(SA)급적매소(GA)적조공,단조공작용불명현.
