计算机工程与设计
計算機工程與設計
계산궤공정여설계
COMPUTER ENGINEERING AND DESIGN
2014年
9期
3080-3084,3223
,共6页
生物信息学%结构稳定性%热力学稳定性%DNA二级结构%最大碱基对匹配%Nearest-Neighbor热力学模型
生物信息學%結構穩定性%熱力學穩定性%DNA二級結構%最大堿基對匹配%Nearest-Neighbor熱力學模型
생물신식학%결구은정성%열역학은정성%DNA이급결구%최대감기대필배%Nearest-Neighbor열역학모형
bioinformatics%the structural stability%the thermodynamic stability%DNA secondary structure%the largest base pairs match%Nearest-Neighbor thermodynamic model
基于DNA分子二级结构的结构稳定性和热力学稳定性,提出一种预测DNA分子二级结构的算法.利用基于矩阵的动态规划算法求解DNA分子最大碱基对匹配的所有二级结构;利用Nearest-Neighbor热力学模型计算所有结构的自由能,自由能在阈值范围内的即为DNA分子可能的二级结构.将实验结果与RNAstructure软件结果进行对比,对比结果表明,该方法具有较高的准确率和覆盖范围.
基于DNA分子二級結構的結構穩定性和熱力學穩定性,提齣一種預測DNA分子二級結構的算法.利用基于矩陣的動態規劃算法求解DNA分子最大堿基對匹配的所有二級結構;利用Nearest-Neighbor熱力學模型計算所有結構的自由能,自由能在閾值範圍內的即為DNA分子可能的二級結構.將實驗結果與RNAstructure軟件結果進行對比,對比結果錶明,該方法具有較高的準確率和覆蓋範圍.
기우DNA분자이급결구적결구은정성화열역학은정성,제출일충예측DNA분자이급결구적산법.이용기우구진적동태규화산법구해DNA분자최대감기대필배적소유이급결구;이용Nearest-Neighbor열역학모형계산소유결구적자유능,자유능재역치범위내적즉위DNA분자가능적이급결구.장실험결과여RNAstructure연건결과진행대비,대비결과표명,해방법구유교고적준학솔화복개범위.
