计算机工程与科学
計算機工程與科學
계산궤공정여과학
COMPUTER ENGINEERING & SCIENCE
2014年
7期
1389-1397
,共9页
非负矩阵分解%微阵列数据%分类分析%聚类发现
非負矩陣分解%微陣列數據%分類分析%聚類髮現
비부구진분해%미진렬수거%분류분석%취류발현
non-negative matrix factorization%microarray data%classification analysis%clustering discovery
基因芯片是微阵列技术的典型代表,它具有高通量的特性和同时检测全部基因组基因表达水平的能力.应用微阵列芯片的一个主要目的是基因表达模式的发现,即在基因组水平发现功能相似,生物学过程相关的基因簇;或者将样本分类,发现样本的各种亚型.例如根据基因表达水平对癌症样本进行分类,发现疾病的分子亚型.非负矩阵分解NMF方法是一种非监督的、非正交的、基于局部表示的矩阵分解方法.近年来这种方法被越来越多地应用在微阵列数据的分类分析和聚类发现中.系统地介绍了非负矩阵分解的原理、算法和应用,分解结果的生物学解释,分类结果的质量评估和基于NMF算法的分类软件.总结并评估了NMF方法在微阵列数据分类和聚类发现应用中的表现.
基因芯片是微陣列技術的典型代錶,它具有高通量的特性和同時檢測全部基因組基因錶達水平的能力.應用微陣列芯片的一箇主要目的是基因錶達模式的髮現,即在基因組水平髮現功能相似,生物學過程相關的基因簇;或者將樣本分類,髮現樣本的各種亞型.例如根據基因錶達水平對癌癥樣本進行分類,髮現疾病的分子亞型.非負矩陣分解NMF方法是一種非鑑督的、非正交的、基于跼部錶示的矩陣分解方法.近年來這種方法被越來越多地應用在微陣列數據的分類分析和聚類髮現中.繫統地介紹瞭非負矩陣分解的原理、算法和應用,分解結果的生物學解釋,分類結果的質量評估和基于NMF算法的分類軟件.總結併評估瞭NMF方法在微陣列數據分類和聚類髮現應用中的錶現.
기인심편시미진렬기술적전형대표,타구유고통량적특성화동시검측전부기인조기인표체수평적능력.응용미진렬심편적일개주요목적시기인표체모식적발현,즉재기인조수평발현공능상사,생물학과정상관적기인족;혹자장양본분류,발현양본적각충아형.례여근거기인표체수평대암증양본진행분류,발현질병적분자아형.비부구진분해NMF방법시일충비감독적、비정교적、기우국부표시적구진분해방법.근년래저충방법피월래월다지응용재미진렬수거적분류분석화취류발현중.계통지개소료비부구진분해적원리、산법화응용,분해결과적생물학해석,분류결과적질량평고화기우NMF산법적분류연건.총결병평고료NMF방법재미진렬수거분류화취류발현응용중적표현.
