广东农业科学
廣東農業科學
엄동농업과학
GUANGDONG AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
13期
140-143,151,前插1
,共6页
黄酮醇合成酶%生物信息学%功能分析%结构预测
黃酮醇閤成酶%生物信息學%功能分析%結構預測
황동순합성매%생물신식학%공능분석%결구예측
采用生物信息学方法和工具分析19种不同植物中的黄酮醇合成酶基因的核苷酸序列及编码氨基酸序列,对其理化特性、功能结构域、亲/疏水性、二级结构、信号肽、跨膜结构域以及分子系统进化关系等进行预测和推断,并构建分子进化树.结果表明,不同植物FLS基因的开放阅读框全长在1.0 kb左右,编码蛋白含330余个氨基酸,呈酸性,是一个没有任何信号肽、转运肽和跨膜结构域的亲水性蛋白.不同植物FLS氨基酸序列包含有黄酮醇合成酶功能域,而且d-螺旋和不规则盘绕是其蛋白质二级结构的最大量结构元件.19个植物FLS在分子进化树中主要聚成3小支,来源于同科植物的FLS首先聚在一起,再与其他物种FLS聚在一起,进化分析在一定程度上反映了这些物种FLS的进化关系.
採用生物信息學方法和工具分析19種不同植物中的黃酮醇閤成酶基因的覈苷痠序列及編碼氨基痠序列,對其理化特性、功能結構域、親/疏水性、二級結構、信號肽、跨膜結構域以及分子繫統進化關繫等進行預測和推斷,併構建分子進化樹.結果錶明,不同植物FLS基因的開放閱讀框全長在1.0 kb左右,編碼蛋白含330餘箇氨基痠,呈痠性,是一箇沒有任何信號肽、轉運肽和跨膜結構域的親水性蛋白.不同植物FLS氨基痠序列包含有黃酮醇閤成酶功能域,而且d-螺鏇和不規則盤繞是其蛋白質二級結構的最大量結構元件.19箇植物FLS在分子進化樹中主要聚成3小支,來源于同科植物的FLS首先聚在一起,再與其他物種FLS聚在一起,進化分析在一定程度上反映瞭這些物種FLS的進化關繫.
채용생물신식학방법화공구분석19충불동식물중적황동순합성매기인적핵감산서렬급편마안기산서렬,대기이화특성、공능결구역、친/소수성、이급결구、신호태、과막결구역이급분자계통진화관계등진행예측화추단,병구건분자진화수.결과표명,불동식물FLS기인적개방열독광전장재1.0 kb좌우,편마단백함330여개안기산,정산성,시일개몰유임하신호태、전운태화과막결구역적친수성단백.불동식물FLS안기산서렬포함유황동순합성매공능역,이차d-라선화불규칙반요시기단백질이급결구적최대량결구원건.19개식물FLS재분자진화수중주요취성3소지,래원우동과식물적FLS수선취재일기,재여기타물충FLS취재일기,진화분석재일정정도상반영료저사물충FLS적진화관계.
