热带作物学报
熱帶作物學報
열대작물학보
CHINESE JOURNAL OF TROPICAL CROPS
2014年
8期
1551-1558
,共8页
李玲%赖钟雄%陈裕坤%练从龙%林鹤延
李玲%賴鐘雄%陳裕坤%練從龍%林鶴延
리령%뢰종웅%진유곤%련종룡%림학연
文心兰%COBRA%克隆%生物信息学%qPCR
文心蘭%COBRA%剋隆%生物信息學%qPCR
문심란%COBRA%극륭%생물신식학%qPCR
Oncidium%COBRA%Clone%Bioinformatics%qPCR
以文心兰试管苗为材料,采用RT-PCR结合RACE法,克隆文心兰OnCOBRA基因的cDNA全长和DNA序列.结果表明:COBRA全长为1 601 bp,开放阅读框(ORF)为1 386 bp,共编码461个氨基酸;OnCOBRA的DNA序列共2 949 bp,且含有6个外显子和5个内含子.生物信息学结果表明,OnCOBRA属于不稳定的疏水蛋白,具有信号肽、跨膜结构和CCVS保守区域,亚细胞定位于细胞膜中;与无油樟、玉米、籼稻、拟南芥等具有较高的同源性.系统进化树分析结果表明,文心兰OnCOBRA蛋白与玉米(ZmCOBRA)、无油樟(AtCOBRA)、籼稻(OsCOBRA)处于统一分枝,推测OnCOBRA基因是COBRA基因家族的成员.qPCR结果表明,OnCORBA为组成型表达,在成苗期表达量最高,在文心兰类原球茎时期表达量最低.
以文心蘭試管苗為材料,採用RT-PCR結閤RACE法,剋隆文心蘭OnCOBRA基因的cDNA全長和DNA序列.結果錶明:COBRA全長為1 601 bp,開放閱讀框(ORF)為1 386 bp,共編碼461箇氨基痠;OnCOBRA的DNA序列共2 949 bp,且含有6箇外顯子和5箇內含子.生物信息學結果錶明,OnCOBRA屬于不穩定的疏水蛋白,具有信號肽、跨膜結構和CCVS保守區域,亞細胞定位于細胞膜中;與無油樟、玉米、秈稻、擬南芥等具有較高的同源性.繫統進化樹分析結果錶明,文心蘭OnCOBRA蛋白與玉米(ZmCOBRA)、無油樟(AtCOBRA)、秈稻(OsCOBRA)處于統一分枝,推測OnCOBRA基因是COBRA基因傢族的成員.qPCR結果錶明,OnCORBA為組成型錶達,在成苗期錶達量最高,在文心蘭類原毬莖時期錶達量最低.
이문심란시관묘위재료,채용RT-PCR결합RACE법,극륭문심란OnCOBRA기인적cDNA전장화DNA서렬.결과표명:COBRA전장위1 601 bp,개방열독광(ORF)위1 386 bp,공편마461개안기산;OnCOBRA적DNA서렬공2 949 bp,차함유6개외현자화5개내함자.생물신식학결과표명,OnCOBRA속우불은정적소수단백,구유신호태、과막결구화CCVS보수구역,아세포정위우세포막중;여무유장、옥미、선도、의남개등구유교고적동원성.계통진화수분석결과표명,문심란OnCOBRA단백여옥미(ZmCOBRA)、무유장(AtCOBRA)、선도(OsCOBRA)처우통일분지,추측OnCOBRA기인시COBRA기인가족적성원.qPCR결과표명,OnCORBA위조성형표체,재성묘기표체량최고,재문심란류원구경시기표체량최저.