中华传染病杂志
中華傳染病雜誌
중화전염병잡지
CHINESE JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES
2014年
7期
13-16
,共4页
孙晖%赵红庆%熊衍文%陈强
孫暉%趙紅慶%熊衍文%陳彊
손휘%조홍경%웅연문%진강
大肠埃希菌 O157%Ⅳ 型分泌系统%质粒%pO157_Sal
大腸埃希菌 O157%Ⅳ 型分泌繫統%質粒%pO157_Sal
대장애희균 O157%Ⅳ 형분비계통%질립%pO157_Sal
Escherichia coli O157%Type Ⅳ secretion system%Plasmid%pO157_Sal
目的:分析我国肠出血性大肠埃希菌 O157∶H7暴发菌株携带的新接合质粒 pO157_Sal的序列特征。方法对我国不同来源携带 pO157_Sal 的大肠埃希菌 O157∶H7暴发菌株进行 traE 基因PCR 扩增、克隆测序,并在 GenBank 中比对检索其他来源大肠埃希菌 O157∶H7菌株的 TraE 序列,以邻接法构建基于 TraE 序列的系统发生树;在全质粒序列水平比较分析 pO157_Sal 与 pEC4115。结果我国不同宿主来源的暴发菌株携带的 traE 基因序列完全相同;pO157_Sal TraE 的相似性序列存在于不同国家不同宿主来源及不同分离年代的大肠埃希菌 O157∶ H7分离株中;pO157_Sal 中21个基因与pEC4115质粒编码的基因存在28%~51%的氨基酸相似性。结论虽然不同来源的大肠埃希菌O157∶H7菌株中存在相似性 TraE 序列或相似质粒 pEC4115,但 pO157_Sal 为我国暴发菌株所特有,其序列在暴发菌株间保守,提示其为特定的相同来源。
目的:分析我國腸齣血性大腸埃希菌 O157∶H7暴髮菌株攜帶的新接閤質粒 pO157_Sal的序列特徵。方法對我國不同來源攜帶 pO157_Sal 的大腸埃希菌 O157∶H7暴髮菌株進行 traE 基因PCR 擴增、剋隆測序,併在 GenBank 中比對檢索其他來源大腸埃希菌 O157∶H7菌株的 TraE 序列,以鄰接法構建基于 TraE 序列的繫統髮生樹;在全質粒序列水平比較分析 pO157_Sal 與 pEC4115。結果我國不同宿主來源的暴髮菌株攜帶的 traE 基因序列完全相同;pO157_Sal TraE 的相似性序列存在于不同國傢不同宿主來源及不同分離年代的大腸埃希菌 O157∶ H7分離株中;pO157_Sal 中21箇基因與pEC4115質粒編碼的基因存在28%~51%的氨基痠相似性。結論雖然不同來源的大腸埃希菌O157∶H7菌株中存在相似性 TraE 序列或相似質粒 pEC4115,但 pO157_Sal 為我國暴髮菌株所特有,其序列在暴髮菌株間保守,提示其為特定的相同來源。
목적:분석아국장출혈성대장애희균 O157∶H7폭발균주휴대적신접합질립 pO157_Sal적서렬특정。방법대아국불동래원휴대 pO157_Sal 적대장애희균 O157∶H7폭발균주진행 traE 기인PCR 확증、극륭측서,병재 GenBank 중비대검색기타래원대장애희균 O157∶H7균주적 TraE 서렬,이린접법구건기우 TraE 서렬적계통발생수;재전질립서렬수평비교분석 pO157_Sal 여 pEC4115。결과아국불동숙주래원적폭발균주휴대적 traE 기인서렬완전상동;pO157_Sal TraE 적상사성서렬존재우불동국가불동숙주래원급불동분리년대적대장애희균 O157∶ H7분리주중;pO157_Sal 중21개기인여pEC4115질립편마적기인존재28%~51%적안기산상사성。결론수연불동래원적대장애희균O157∶H7균주중존재상사성 TraE 서렬혹상사질립 pEC4115,단 pO157_Sal 위아국폭발균주소특유,기서렬재폭발균주간보수,제시기위특정적상동래원。
Objective To analyze the sequence of the novel conjugative plasmid pO157_Sal detected in outbreak isolates of Escherichia coli O157∶H7 .Methods The traE genes of the outbreak isolates in China were amplified by polymerase chain reaction (PCR) and the products were sequenced .The TraE sequences of Escherichia coli O157 ∶ H7 strains from other sources were retrieved from GenBank . Phylogenetic tree based on the TraE sequences was constructed by Neibhor-joining analysis .The whole plasmid sequences of pO157_Sal and pEC4115 were compared .Results The sequences of traE gene were identical among the Chinese isolates . There were homologous sequences of TraE in Escherichia coli O157∶H7 isolates from different sources .Twenty-one out of the 52 pO157_Sal genes were homologous to genes of pEC4115 with amino acid level identity ranging from 28% to 51% .Conclusions Although similar TraE sequences and similar plasmid are found in Escherichia coli O157∶H7 isolates from different sources ,pO157_Sal is only observed in Chinese outbreak isolates .The TraE sequences are conservative among the outbreak isolates ,indicating they are from the same specific source .