计算机应用
計算機應用
계산궤응용
COMPUTER APPLICATION
2014年
7期
2129-2131,2144
,共4页
李怀松%袁琴%王才华%刘娟
李懷鬆%袁琴%王纔華%劉娟
리부송%원금%왕재화%류연
蛋白质描述%小分子描述%蛋白质—小分子相互作用模型%二部图%片段
蛋白質描述%小分子描述%蛋白質—小分子相互作用模型%二部圖%片段
단백질묘술%소분자묘술%단백질—소분자상호작용모형%이부도%편단
protein representation%compound representation%protein-compound interaction%bipartite graph%fragment
构建可解释和可大规模计算的蛋白质—小分子相互作用模型是一个重要的课题.提出一种新的蛋白质—小分子相互作用模型:首先分别用氨基酸三聚物集群和化合物结构片段来描述蛋白质和小分子;然后将蛋白质和小分子片段作为二部图的两部分,片段间的相互作用强度作为二部图的边;最后蛋白质和小分子的相互作用则是蛋白质片段和小分子片段之间相互作用的叠加.实验结果表明,该模型预测的准确率达到97%且具有很好的解释性.
構建可解釋和可大規模計算的蛋白質—小分子相互作用模型是一箇重要的課題.提齣一種新的蛋白質—小分子相互作用模型:首先分彆用氨基痠三聚物集群和化閤物結構片段來描述蛋白質和小分子;然後將蛋白質和小分子片段作為二部圖的兩部分,片段間的相互作用彊度作為二部圖的邊;最後蛋白質和小分子的相互作用則是蛋白質片段和小分子片段之間相互作用的疊加.實驗結果錶明,該模型預測的準確率達到97%且具有很好的解釋性.
구건가해석화가대규모계산적단백질—소분자상호작용모형시일개중요적과제.제출일충신적단백질—소분자상호작용모형:수선분별용안기산삼취물집군화화합물결구편단래묘술단백질화소분자;연후장단백질화소분자편단작위이부도적량부분,편단간적상호작용강도작위이부도적변;최후단백질화소분자적상호작용칙시단백질편단화소분자편단지간상호작용적첩가.실험결과표명,해모형예측적준학솔체도97%차구유흔호적해석성.