广东农业科学
廣東農業科學
엄동농업과학
GUANGDONG AGRICULTURAL SCIENCES
2014年
14期
139-143
,共5页
张哲%贺金龙%邓熙%高宁%吴海娥%张豪%李加琪
張哲%賀金龍%鄧熙%高寧%吳海娥%張豪%李加琪
장철%하금룡%산희%고저%오해아%장호%리가기
猪%全基因组关联分析%候选基因%生产性状
豬%全基因組關聯分析%候選基因%生產性狀
저%전기인조관련분석%후선기인%생산성상
对猪全基因组高密度SNP基因型数据及生长性状表型数据进行全基因组关联分析,以期找到影响这些性状的候选基因,更准确地了解这些生长性状的遗传基础.利用Illumina猪60K SNP芯片对191头杜洛克猪进行基因型检测,使用R语言环境下GenABEL软件包提供的单标记回归分析模型,对体重达100 kg日龄(D100)、活体背膘厚(BFT)和活体眼肌面积(LMA)3个生长性状的表型分别进行全基因组关联分析.在D100和LMA2个性状中分别检测到1个基因组水平和6个染色体水平显著关联的SNP,均位于5号染色体;没有检测到与BFT显著相关的SNP.生物信息学分析表明,BTG1和EFCA B6可能是影响生长性状的重要候选基因,但其功能有待进一步研究确认.
對豬全基因組高密度SNP基因型數據及生長性狀錶型數據進行全基因組關聯分析,以期找到影響這些性狀的候選基因,更準確地瞭解這些生長性狀的遺傳基礎.利用Illumina豬60K SNP芯片對191頭杜洛剋豬進行基因型檢測,使用R語言環境下GenABEL軟件包提供的單標記迴歸分析模型,對體重達100 kg日齡(D100)、活體揹膘厚(BFT)和活體眼肌麵積(LMA)3箇生長性狀的錶型分彆進行全基因組關聯分析.在D100和LMA2箇性狀中分彆檢測到1箇基因組水平和6箇染色體水平顯著關聯的SNP,均位于5號染色體;沒有檢測到與BFT顯著相關的SNP.生物信息學分析錶明,BTG1和EFCA B6可能是影響生長性狀的重要候選基因,但其功能有待進一步研究確認.
대저전기인조고밀도SNP기인형수거급생장성상표형수거진행전기인조관련분석,이기조도영향저사성상적후선기인,경준학지료해저사생장성상적유전기출.이용Illumina저60K SNP심편대191두두락극저진행기인형검측,사용R어언배경하GenABEL연건포제공적단표기회귀분석모형,대체중체100 kg일령(D100)、활체배표후(BFT)화활체안기면적(LMA)3개생장성상적표형분별진행전기인조관련분석.재D100화LMA2개성상중분별검측도1개기인조수평화6개염색체수평현저관련적SNP,균위우5호염색체;몰유검측도여BFT현저상관적SNP.생물신식학분석표명,BTG1화EFCA B6가능시영향생장성상적중요후선기인,단기공능유대진일보연구학인.
