CAJ | 학술논문

凡纳滨对虾是我国乃至世界最重要的对虾养殖种。EST（expressed sequence tags）测序是对没有基因组背景的生物进行功能基因分析最为有效的方法之一。为了研究凡纳滨对虾重要功能基因、以及为筛选分子标记奠定基础，本文集成了一套快速高效的EST信息深度挖掘的方法，并对公共数据库中161241条凡纳滨对虾EST序列进行分析，获得了20410条unigenes，包括14236条contigs和6174条singlets。通过与NR数据库比对发现有注释的基因7984条，并对其余12426条未知基因中的4702条进行了功能域注释。对有NR注释的基因的GO分类分析获得其中2715条基因的生物学过程、细胞定位和分子功能分类信息。此外，通过与模式生物通路图进行比对和定位，将3738条基因定位到270个KEGG 通路图中，发现凡纳滨对虾的9条 unigenes 与果蝇丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）通路的5个关键基因对应，提示凡纳滨对虾很可能存在类似的重要信号转导通路。另外，通过对6种组织，包括肝胰腺、淋巴器官、血细胞、鳃、眼柄和神经的EST进行比较分析，筛选获得了组织特异性转录本共7000余条，并对这些特异性转录本进行了功能分类。本研究不仅开发了公共基因资源发掘的方法，也为对虾功能基因的研究利用提供了重要参考数据。
범납빈대하시아국내지세계최중요적대하양식충。EST（expressed sequence tags）측서시대몰유기인조배경적생물진행공능기인분석최위유효적방법지일。위료연구범납빈대하중요공능기인、이급위사선분자표기전정기출，본문집성료일투쾌속고효적EST신식심도알굴적방법，병대공공수거고중161241조범납빈대하EST서렬진행분석，획득료20410조unigenes，포괄14236조contigs화6174조singlets。통과여NR수거고비대발현유주석적기인7984조，병대기여12426조미지기인중적4702조진행료공능역주석。대유NR주석적기인적GO분류분석획득기중2715조기인적생물학과정、세포정위화분자공능분류신식。차외，통과여모식생물통로도진행비대화정위，장3738조기인정위도270개KEGG 통로도중，발현범납빈대하적9조 unigenes 여과승사렬원활화단백격매（MAPK）통로적5개관건기인대응，제시범납빈대하흔가능존재유사적중요신호전도통로。령외，통과대6충조직，포괄간이선、림파기관、혈세포、새、안병화신경적EST진행비교분석，사선획득료조직특이성전록본공7000여조，병대저사특이성전록본진행료공능분류。본연구불부개발료공공기인자원발굴적방법，야위대하공능기인적연구이용제공료중요삼고수거。