中国畜牧杂志
中國畜牧雜誌
중국축목잡지
CHINESE JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE
2013年
21期
14-18
,共5页
杨莉%董雅娟%柏学进%赵仕全%牛召珊%张新浩
楊莉%董雅娟%柏學進%趙仕全%牛召珊%張新浩
양리%동아연%백학진%조사전%우소산%장신호
CoQ10%PDSS1%克隆测序%生物信息学%布莱凯特黑牛
CoQ10%PDSS1%剋隆測序%生物信息學%佈萊凱特黑牛
CoQ10%PDSS1%극륭측서%생물신식학%포래개특흑우
对布莱凯特黑牛PDSS1基因cDNA进行克隆测序,为进一步研究PDSS1基因与布莱凯特黑牛胴体内CoQ10含量、肉质性状等的相关性提供理论基础.针对Ensembl公布的牛(参照)PDSS1基因中11个外显子,设计9对引物,对布莱凯特黑牛基因组DNA进行PCR扩增、克隆测序;利用软件Lasergene 7.0拼接出PDSS1基因cDNA,提交至GenBank并进行生物信息学分析.结果表明:布莱凯特黑牛PDSS1基因cDNA全长1 574 bp,包括一个长1 257 bp的完整开放阅读框,编码418个氨基酸.PDSS1蛋白含5个跨膜区,信号肽由26个氨基酸组成,成熟肽由392个氨基酸组成.布莱凯特黑牛与牛(参照)、海福特牛、马、猪、犬、小鼠、黑猩猩、人在编码区核酸序列同源性依次为99.9%、99.8%、89.0%、83.1%、88.6%、81.1%、80.8%、80.9%;推导氨基酸序列的同源性依次为100%、99.8%、92.0%、81.8%、91.6%、79.0%、80.4%、80.7%.本试验成功克隆了布莱凯特黑牛PDSS1基因cDNA,并提交至GenBank(登录号:KC787698).布莱凯特黑牛与牛(参照)、海福特牛在PDSS1基因编码区的同源性极高,聚为一类;与马、犬、猪、小鼠、人、黑猩猩等物种的同源性相对低些.
對佈萊凱特黑牛PDSS1基因cDNA進行剋隆測序,為進一步研究PDSS1基因與佈萊凱特黑牛胴體內CoQ10含量、肉質性狀等的相關性提供理論基礎.針對Ensembl公佈的牛(參照)PDSS1基因中11箇外顯子,設計9對引物,對佈萊凱特黑牛基因組DNA進行PCR擴增、剋隆測序;利用軟件Lasergene 7.0拼接齣PDSS1基因cDNA,提交至GenBank併進行生物信息學分析.結果錶明:佈萊凱特黑牛PDSS1基因cDNA全長1 574 bp,包括一箇長1 257 bp的完整開放閱讀框,編碼418箇氨基痠.PDSS1蛋白含5箇跨膜區,信號肽由26箇氨基痠組成,成熟肽由392箇氨基痠組成.佈萊凱特黑牛與牛(參照)、海福特牛、馬、豬、犬、小鼠、黑猩猩、人在編碼區覈痠序列同源性依次為99.9%、99.8%、89.0%、83.1%、88.6%、81.1%、80.8%、80.9%;推導氨基痠序列的同源性依次為100%、99.8%、92.0%、81.8%、91.6%、79.0%、80.4%、80.7%.本試驗成功剋隆瞭佈萊凱特黑牛PDSS1基因cDNA,併提交至GenBank(登錄號:KC787698).佈萊凱特黑牛與牛(參照)、海福特牛在PDSS1基因編碼區的同源性極高,聚為一類;與馬、犬、豬、小鼠、人、黑猩猩等物種的同源性相對低些.
대포래개특흑우PDSS1기인cDNA진행극륭측서,위진일보연구PDSS1기인여포래개특흑우동체내CoQ10함량、육질성상등적상관성제공이론기출.침대Ensembl공포적우(삼조)PDSS1기인중11개외현자,설계9대인물,대포래개특흑우기인조DNA진행PCR확증、극륭측서;이용연건Lasergene 7.0병접출PDSS1기인cDNA,제교지GenBank병진행생물신식학분석.결과표명:포래개특흑우PDSS1기인cDNA전장1 574 bp,포괄일개장1 257 bp적완정개방열독광,편마418개안기산.PDSS1단백함5개과막구,신호태유26개안기산조성,성숙태유392개안기산조성.포래개특흑우여우(삼조)、해복특우、마、저、견、소서、흑성성、인재편마구핵산서렬동원성의차위99.9%、99.8%、89.0%、83.1%、88.6%、81.1%、80.8%、80.9%;추도안기산서렬적동원성의차위100%、99.8%、92.0%、81.8%、91.6%、79.0%、80.4%、80.7%.본시험성공극륭료포래개특흑우PDSS1기인cDNA,병제교지GenBank(등록호:KC787698).포래개특흑우여우(삼조)、해복특우재PDSS1기인편마구적동원성겁고,취위일류;여마、견、저、소서、인、흑성성등물충적동원성상대저사.