农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2014年
4期
432-439
,共8页
陈晓婷%刘军%孙翠霞%林桂芳
陳曉婷%劉軍%孫翠霞%林桂芳
진효정%류군%손취하%림계방
拟南芥%差异表达谱%microRNA芯片%草酸
擬南芥%差異錶達譜%microRNA芯片%草痠
의남개%차이표체보%microRNA심편%초산
Arabidopsis thaliana%Differential expression profile%microRNA microarray%Oxalic acid
草酸是多种植物病原真菌(如核盘菌,灰葡萄孢等)的重要致病因子,这些草酸产生菌在侵染植物时,会分泌草酸来酸化寄主组织,使得病原真菌的细胞壁降解酶能更迅速地协同发挥作用,加速细胞的降解,而且草酸可夺取寄主细胞壁的钙离子形成草酸钙结晶从而破坏寄主细胞壁.植物microRNA广泛参与植物生长发育各阶段的基因表达调控,在抗生物或非生物胁迫的应答中发挥着重要的作用.本研究基于植物microRNA芯片研究3周龄拟南芥(Arabidopsis thaliana)在30 mmol/L草酸胁迫下microRNA的表达.获得3个差异表达的microRNA:miRNA-2988 (Ptc-miR3911),miRNA-3090 (Ath-miR858),miRNA-3131(Ppt-miR1211).根据psRNATarget,对下调表达的小立碗藓(Physcomitrella patens) Ppt-miR1211的同源物,找到一个最匹配的靶mRNA是At5g35753;另一下调表达的毛果杨(Populus trichocarpa)Ptc-miR3 991(与Ath-miR399b同源)的同源物,对应的靶mRNA是一个泛素连接酶(At2g33770);上调表达的Ath-miR858有4个靶mRNA,分别为At2g47460 (AtMYB12)、At5g49330 (AtMYB111)、At1g06180 (AtMYB13)和At1 g66230 (AtMYB20).草酸胁迫下,qRT-PCR对其中下调表达的两个Ppt-miR 1211及Ptc-miR3991同源物的靶基因的表达情况分析表明,At5g35753及At2g33770在草酸胁迫2h后被诱导表达,于12h达到峰值,24 h后表达量下降;qRT-PCR还表明:在草酸胁迫1h后,Ath-miR858确实被诱导表达,于12h达到峰值,24 h后表达量下降,其靶基因MYB在草酸胁迫早期(2 h内)多数有下调的趋势,表明microRNA对其靶mRNA确有负调控.此外,还对Ath-miR858与Ath-miR399b的启动子进行了生物信息学分析.本研究结果为microRNA在拟南芥抗草酸胁迫中的作用提供了依据.
草痠是多種植物病原真菌(如覈盤菌,灰葡萄孢等)的重要緻病因子,這些草痠產生菌在侵染植物時,會分泌草痠來痠化寄主組織,使得病原真菌的細胞壁降解酶能更迅速地協同髮揮作用,加速細胞的降解,而且草痠可奪取寄主細胞壁的鈣離子形成草痠鈣結晶從而破壞寄主細胞壁.植物microRNA廣汎參與植物生長髮育各階段的基因錶達調控,在抗生物或非生物脅迫的應答中髮揮著重要的作用.本研究基于植物microRNA芯片研究3週齡擬南芥(Arabidopsis thaliana)在30 mmol/L草痠脅迫下microRNA的錶達.穫得3箇差異錶達的microRNA:miRNA-2988 (Ptc-miR3911),miRNA-3090 (Ath-miR858),miRNA-3131(Ppt-miR1211).根據psRNATarget,對下調錶達的小立碗蘚(Physcomitrella patens) Ppt-miR1211的同源物,找到一箇最匹配的靶mRNA是At5g35753;另一下調錶達的毛果楊(Populus trichocarpa)Ptc-miR3 991(與Ath-miR399b同源)的同源物,對應的靶mRNA是一箇汎素連接酶(At2g33770);上調錶達的Ath-miR858有4箇靶mRNA,分彆為At2g47460 (AtMYB12)、At5g49330 (AtMYB111)、At1g06180 (AtMYB13)和At1 g66230 (AtMYB20).草痠脅迫下,qRT-PCR對其中下調錶達的兩箇Ppt-miR 1211及Ptc-miR3991同源物的靶基因的錶達情況分析錶明,At5g35753及At2g33770在草痠脅迫2h後被誘導錶達,于12h達到峰值,24 h後錶達量下降;qRT-PCR還錶明:在草痠脅迫1h後,Ath-miR858確實被誘導錶達,于12h達到峰值,24 h後錶達量下降,其靶基因MYB在草痠脅迫早期(2 h內)多數有下調的趨勢,錶明microRNA對其靶mRNA確有負調控.此外,還對Ath-miR858與Ath-miR399b的啟動子進行瞭生物信息學分析.本研究結果為microRNA在擬南芥抗草痠脅迫中的作用提供瞭依據.
초산시다충식물병원진균(여핵반균,회포도포등)적중요치병인자,저사초산산생균재침염식물시,회분비초산래산화기주조직,사득병원진균적세포벽강해매능경신속지협동발휘작용,가속세포적강해,이차초산가탈취기주세포벽적개리자형성초산개결정종이파배기주세포벽.식물microRNA엄범삼여식물생장발육각계단적기인표체조공,재항생물혹비생물협박적응답중발휘착중요적작용.본연구기우식물microRNA심편연구3주령의남개(Arabidopsis thaliana)재30 mmol/L초산협박하microRNA적표체.획득3개차이표체적microRNA:miRNA-2988 (Ptc-miR3911),miRNA-3090 (Ath-miR858),miRNA-3131(Ppt-miR1211).근거psRNATarget,대하조표체적소립완선(Physcomitrella patens) Ppt-miR1211적동원물,조도일개최필배적파mRNA시At5g35753;령일하조표체적모과양(Populus trichocarpa)Ptc-miR3 991(여Ath-miR399b동원)적동원물,대응적파mRNA시일개범소련접매(At2g33770);상조표체적Ath-miR858유4개파mRNA,분별위At2g47460 (AtMYB12)、At5g49330 (AtMYB111)、At1g06180 (AtMYB13)화At1 g66230 (AtMYB20).초산협박하,qRT-PCR대기중하조표체적량개Ppt-miR 1211급Ptc-miR3991동원물적파기인적표체정황분석표명,At5g35753급At2g33770재초산협박2h후피유도표체,우12h체도봉치,24 h후표체량하강;qRT-PCR환표명:재초산협박1h후,Ath-miR858학실피유도표체,우12h체도봉치,24 h후표체량하강,기파기인MYB재초산협박조기(2 h내)다수유하조적추세,표명microRNA대기파mRNA학유부조공.차외,환대Ath-miR858여Ath-miR399b적계동자진행료생물신식학분석.본연구결과위microRNA재의남개항초산협박중적작용제공료의거.
