农业生物技术学报
農業生物技術學報
농업생물기술학보
JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
2014年
4期
415-421
,共7页
史婷婷%王深浩%林涛%杨清%黄三文
史婷婷%王深浩%林濤%楊清%黃三文
사정정%왕심호%림도%양청%황삼문
黄瓜%叶面积%little leaf 2(ll2)%QTL定位
黃瓜%葉麵積%little leaf 2(ll2)%QTL定位
황과%협면적%little leaf 2(ll2)%QTL정위
Cucumis sativus L.%Leaf area%little leaf2(ll2)%QTL mapping
叶片面积影响光合作用效率,是农作物产量的重要构成性状之一.野生黄瓜(Cucumis sativus var.hardwickii)的叶片较小,经过人工驯化后的栽培黄瓜(Cucumis sativus var.sativus)的叶片面积扩大了2~3倍.前人研究已经将控制黄瓜叶面积的主效基因之一ll (little leaf)定位在第6号染色体上.本研究以黄瓜小叶品系XF-24(P1)、大叶品系DF-32(P2)杂交产生的205个单株的F2群体为研究材料,用SAS软件对成熟期调查的各单株相同节位的叶面积进行正态性检验,结果服从正态分布,符合数量性状的遗传特征.为了有效地加快研究进程,在双亲测序情况下,采用插入缺失位点(insertion and deletion,InDel)标记进行基因定位.研究结合双亲全基因组测序数据,生物信息学分析得出双亲序列之间的InDel位点,用Primer Premier 5.0软件在所有染色体上均匀设计88对InDel标记引物,扩增采用分离群体分组混合分析法(bulked segregant analysis,BSA)组建大叶、小叶基因池,池间有多态的引物再进一步扩增F2群体DNA,筛选到7个与黄瓜叶面积基因ll2连锁的分子标记,位于黄瓜第7号染色体上,分别是InDel-1、InDel-2、InDel-3、InDel-4、InDel-5、InDel-6、InDel-7.建立遗传连锁图谱并进行区间作图寻找QTL位点,结果显示,遗传连锁图谱包含以上7个InDel标记,连锁区间为22.1 cM,包括1个控制黄瓜叶片大小的主效QTL位点ll2 (little leaf2),位于标记InDel-2与InDel-4之间,这两个标记之间物理距离为1.24 Mb.与前人的研究结果相比,定位区间更小且是7号染色体上首次发现的黄瓜叶面积QTL位点.截止目前,在黄瓜6号、7号染色体共发现了2个黄瓜叶面积主效QTL位点,分别是ll和ll2,表明黄瓜叶面积遗传机制复杂.叶面积主效QTL ll2的遗传定位,对于控制黄瓜叶片面积的遗传机制和分子机理研究以及分子标记辅助育种具有重要的意义.
葉片麵積影響光閤作用效率,是農作物產量的重要構成性狀之一.野生黃瓜(Cucumis sativus var.hardwickii)的葉片較小,經過人工馴化後的栽培黃瓜(Cucumis sativus var.sativus)的葉片麵積擴大瞭2~3倍.前人研究已經將控製黃瓜葉麵積的主效基因之一ll (little leaf)定位在第6號染色體上.本研究以黃瓜小葉品繫XF-24(P1)、大葉品繫DF-32(P2)雜交產生的205箇單株的F2群體為研究材料,用SAS軟件對成熟期調查的各單株相同節位的葉麵積進行正態性檢驗,結果服從正態分佈,符閤數量性狀的遺傳特徵.為瞭有效地加快研究進程,在雙親測序情況下,採用插入缺失位點(insertion and deletion,InDel)標記進行基因定位.研究結閤雙親全基因組測序數據,生物信息學分析得齣雙親序列之間的InDel位點,用Primer Premier 5.0軟件在所有染色體上均勻設計88對InDel標記引物,擴增採用分離群體分組混閤分析法(bulked segregant analysis,BSA)組建大葉、小葉基因池,池間有多態的引物再進一步擴增F2群體DNA,篩選到7箇與黃瓜葉麵積基因ll2連鎖的分子標記,位于黃瓜第7號染色體上,分彆是InDel-1、InDel-2、InDel-3、InDel-4、InDel-5、InDel-6、InDel-7.建立遺傳連鎖圖譜併進行區間作圖尋找QTL位點,結果顯示,遺傳連鎖圖譜包含以上7箇InDel標記,連鎖區間為22.1 cM,包括1箇控製黃瓜葉片大小的主效QTL位點ll2 (little leaf2),位于標記InDel-2與InDel-4之間,這兩箇標記之間物理距離為1.24 Mb.與前人的研究結果相比,定位區間更小且是7號染色體上首次髮現的黃瓜葉麵積QTL位點.截止目前,在黃瓜6號、7號染色體共髮現瞭2箇黃瓜葉麵積主效QTL位點,分彆是ll和ll2,錶明黃瓜葉麵積遺傳機製複雜.葉麵積主效QTL ll2的遺傳定位,對于控製黃瓜葉片麵積的遺傳機製和分子機理研究以及分子標記輔助育種具有重要的意義.
협편면적영향광합작용효솔,시농작물산량적중요구성성상지일.야생황과(Cucumis sativus var.hardwickii)적협편교소,경과인공순화후적재배황과(Cucumis sativus var.sativus)적협편면적확대료2~3배.전인연구이경장공제황과협면적적주효기인지일ll (little leaf)정위재제6호염색체상.본연구이황과소협품계XF-24(P1)、대협품계DF-32(P2)잡교산생적205개단주적F2군체위연구재료,용SAS연건대성숙기조사적각단주상동절위적협면적진행정태성검험,결과복종정태분포,부합수량성상적유전특정.위료유효지가쾌연구진정,재쌍친측서정황하,채용삽입결실위점(insertion and deletion,InDel)표기진행기인정위.연구결합쌍친전기인조측서수거,생물신식학분석득출쌍친서렬지간적InDel위점,용Primer Premier 5.0연건재소유염색체상균균설계88대InDel표기인물,확증채용분리군체분조혼합분석법(bulked segregant analysis,BSA)조건대협、소협기인지,지간유다태적인물재진일보확증F2군체DNA,사선도7개여황과협면적기인ll2련쇄적분자표기,위우황과제7호염색체상,분별시InDel-1、InDel-2、InDel-3、InDel-4、InDel-5、InDel-6、InDel-7.건립유전련쇄도보병진행구간작도심조QTL위점,결과현시,유전련쇄도보포함이상7개InDel표기,련쇄구간위22.1 cM,포괄1개공제황과협편대소적주효QTL위점ll2 (little leaf2),위우표기InDel-2여InDel-4지간,저량개표기지간물리거리위1.24 Mb.여전인적연구결과상비,정위구간경소차시7호염색체상수차발현적황과협면적QTL위점.절지목전,재황과6호、7호염색체공발현료2개황과협면적주효QTL위점,분별시ll화ll2,표명황과협면적유전궤제복잡.협면적주효QTL ll2적유전정위,대우공제황과협편면적적유전궤제화분자궤리연구이급분자표기보조육충구유중요적의의.