计算机仿真
計算機倣真
계산궤방진
COMPUTER SIMULATION
2013年
9期
398-401
,共4页
动态模拟%轨迹动画%主元分析%格式解析
動態模擬%軌跡動畫%主元分析%格式解析
동태모의%궤적동화%주원분석%격식해석
Dynamic simulation%Trajectory animation%Essential dynamics%Format parsing
传统实现蛋白质分子动态模拟均采用采样方式生成原子运动轨迹.较大的采样间距使原本光滑的轨迹由于时域影响变得凹凸,而小的采样间距使运动缓慢且难以辨别.为解决上述问题,提出一种基于主元分析的运动轨迹生成算法.在参考坐标系内采集所有原子位置数据,计算并构造位置差的协方差矩阵,选择主元构成新基作为投影向量,确定兴趣运动点.以PYP为例,实验验证,通过提出的算法仿真PYP运动平滑而又凸显重点.
傳統實現蛋白質分子動態模擬均採用採樣方式生成原子運動軌跡.較大的採樣間距使原本光滑的軌跡由于時域影響變得凹凸,而小的採樣間距使運動緩慢且難以辨彆.為解決上述問題,提齣一種基于主元分析的運動軌跡生成算法.在參攷坐標繫內採集所有原子位置數據,計算併構造位置差的協方差矩陣,選擇主元構成新基作為投影嚮量,確定興趣運動點.以PYP為例,實驗驗證,通過提齣的算法倣真PYP運動平滑而又凸顯重點.
전통실현단백질분자동태모의균채용채양방식생성원자운동궤적.교대적채양간거사원본광활적궤적유우시역영향변득요철,이소적채양간거사운동완만차난이변별.위해결상술문제,제출일충기우주원분석적운동궤적생성산법.재삼고좌표계내채집소유원자위치수거,계산병구조위치차적협방차구진,선택주원구성신기작위투영향량,학정흥취운동점.이PYP위례,실험험증,통과제출적산법방진PYP운동평활이우철현중점.
