CAJ | 학술논문

SSR标记是一种广泛应用的分子标记技术,在可可基因组的研究中发挥了重要的作用.本研究运用生物信息学的方法,对可可全基因组进行了扫描,共得到10,4653个SSR区段.对这些SSR区段进行分析,发现含有碱基数目不同的重复单元之间具有较大的差异:含有七核苷酸的重复单元最多,为70,414个,占所有重复单元总数的67.3％;其次为二核苷酸重复单元,为23,272个,占总数的22.2％.在各类SSR单元中,不同核苷酸重复单元出现的频率有明显的差异,其中富含A/T重复单元的SSR单元数目最多,占总数的67％;而C/G重复单元的SSR单元数目较少,约占总数的0.02％.利用SSR单元的位点信息,设计出了65,861对引物,并在可可基因组中进行了电子PCR扩增验证,结果显示100％的引物均能扩增出产物条带.在可可基因组中大规模开发的SSR标记,将为可可的进化、分类和遗传多样性研究提供参考.
SSR표기시일충엄범응용적분자표기기술,재가가기인조적연구중발휘료중요적작용.본연구운용생물신식학적방법,대가가전기인조진행료소묘,공득도10,4653개SSR구단.대저사SSR구단진행분석,발현함유감기수목불동적중복단원지간구유교대적차이:함유칠핵감산적중복단원최다,위70,414개,점소유중복단원총수적67.3％;기차위이핵감산중복단원,위23,272개,점총수적22.2％.재각류SSR단원중,불동핵감산중복단원출현적빈솔유명현적차이,기중부함A/T중복단원적SSR단원수목최다,점총수적67％;이C/G중복단원적SSR단원수목교소,약점총수적0.02％.이용SSR단원적위점신식,설계출료65,861대인물,병재가가기인조중진행료전자PCR확증험증,결과현시100％적인물균능확증출산물조대.재가가기인조중대규모개발적SSR표기,장위가가적진화、분류화유전다양성연구제공삼고.