云南农业大学学报
雲南農業大學學報
운남농업대학학보
JOURNAL OF YUNNAN AGRICULTURAL UNIVERSITY
2013年
5期
741-744
,共4页
张波%刘林%兰茗清%杨静%查友贵%赵婧%李成云
張波%劉林%蘭茗清%楊靜%查友貴%趙婧%李成雲
장파%류림%란명청%양정%사우귀%조청%리성운
聚丙烯酰胺凝胶电泳%DNA片段大小%像素%logistic函数
聚丙烯酰胺凝膠電泳%DNA片段大小%像素%logistic函數
취병희선알응효전영%DNA편단대소%상소%logistic함수
polyacrylamide gel electrophoresis%DNA size%pixel%logistic function
利用聚丙烯酰胺凝胶电泳对PCR产物进行分离是一项基础性的、常用实验技术,但根据DNA在聚丙烯酰胺凝胶电泳上距离读出目的DNA片段大小的方法尚未见报道.本文首次探讨了DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳条带的像素与其条带之间大小的关系,使用SPSS对条带对应的像素值和对应的条带大小进行了线性函数、二次多项式、复合函数、增长函数、对数函数、三次多项式、S型曲线、指数函数、倒数(反比例)函数、幂函数和logistic函数11种函数的拟合分析,结果表明:条带对应的像素值与其对应条带的大小相关系数均达0.950以上的函数主要有复合函数、增长函数、三次多项式、指数函数、倒数函数、幂函数和logistic函数,其中相关性最好的是logistic函数,其相关系数为0.998;而且,通过logistic函数算出的7条目标条带的测算值与实际DNA片段的值最接近,各片段大小的测算值与实际片段大小仅相差5~17 bp.以上结果表明,logis-tic函数能够较准确的放映出经聚丙烯酰胺凝胶电泳后DNA的像素值与其片段大小之间的关系.这将有利于开发出电泳后直接读取DNA片段大小的软件.
利用聚丙烯酰胺凝膠電泳對PCR產物進行分離是一項基礎性的、常用實驗技術,但根據DNA在聚丙烯酰胺凝膠電泳上距離讀齣目的DNA片段大小的方法尚未見報道.本文首次探討瞭DNA聚丙烯酰胺凝膠電泳條帶的像素與其條帶之間大小的關繫,使用SPSS對條帶對應的像素值和對應的條帶大小進行瞭線性函數、二次多項式、複閤函數、增長函數、對數函數、三次多項式、S型麯線、指數函數、倒數(反比例)函數、冪函數和logistic函數11種函數的擬閤分析,結果錶明:條帶對應的像素值與其對應條帶的大小相關繫數均達0.950以上的函數主要有複閤函數、增長函數、三次多項式、指數函數、倒數函數、冪函數和logistic函數,其中相關性最好的是logistic函數,其相關繫數為0.998;而且,通過logistic函數算齣的7條目標條帶的測算值與實際DNA片段的值最接近,各片段大小的測算值與實際片段大小僅相差5~17 bp.以上結果錶明,logis-tic函數能夠較準確的放映齣經聚丙烯酰胺凝膠電泳後DNA的像素值與其片段大小之間的關繫.這將有利于開髮齣電泳後直接讀取DNA片段大小的軟件.
이용취병희선알응효전영대PCR산물진행분리시일항기출성적、상용실험기술,단근거DNA재취병희선알응효전영상거리독출목적DNA편단대소적방법상미견보도.본문수차탐토료DNA취병희선알응효전영조대적상소여기조대지간대소적관계,사용SPSS대조대대응적상소치화대응적조대대소진행료선성함수、이차다항식、복합함수、증장함수、대수함수、삼차다항식、S형곡선、지수함수、도수(반비례)함수、멱함수화logistic함수11충함수적의합분석,결과표명:조대대응적상소치여기대응조대적대소상관계수균체0.950이상적함수주요유복합함수、증장함수、삼차다항식、지수함수、도수함수、멱함수화logistic함수,기중상관성최호적시logistic함수,기상관계수위0.998;이차,통과logistic함수산출적7조목표조대적측산치여실제DNA편단적치최접근,각편단대소적측산치여실제편단대소부상차5~17 bp.이상결과표명,logis-tic함수능구교준학적방영출경취병희선알응효전영후DNA적상소치여기편단대소지간적관계.저장유리우개발출전영후직접독취DNA편단대소적연건.