化学与生物工程
化學與生物工程
화학여생물공정
CHEMISTRY & BIOENGINEERING
2013年
9期
32-34,50
,共4页
黄粉虫%纤溶酶%三维结构%序列
黃粉蟲%纖溶酶%三維結構%序列
황분충%섬용매%삼유결구%서렬
Tenebrio molitor%fibrinolysin%3D-structure%sequence
为了深入研究黄粉虫纤溶酶的纤溶机理,用生物信息学方法对黄粉虫纤溶酶进行了三维结构模拟与序列分析.首先找到了其活性中心,利用Biosun软件的同源模建技术,模拟了黄粉虫纤溶酶的三维结构;利用Goldkey软件,对黄粉虫纤溶酶的氨基酸序列进行了分析,重点讨论了其等电点、亲水性、柔性与催化活性之间的关系,最后对纤维蛋白水解部位结构进行了分析.结果表明,黄粉虫纤溶酶的活性中心是组氨酸、丝氨酸和天冬氨酸三个氨基酸残基,位于球蛋白中心凹穴处,底物结合部位是丝氨酸、天冬氨酸和甘氨酸.从微观分子水平上阐述了该类酶水解纤维蛋白的机理是催化精氨酸-赖氨酸肽键水解,与报道的纤维蛋白的溶解机理相符.
為瞭深入研究黃粉蟲纖溶酶的纖溶機理,用生物信息學方法對黃粉蟲纖溶酶進行瞭三維結構模擬與序列分析.首先找到瞭其活性中心,利用Biosun軟件的同源模建技術,模擬瞭黃粉蟲纖溶酶的三維結構;利用Goldkey軟件,對黃粉蟲纖溶酶的氨基痠序列進行瞭分析,重點討論瞭其等電點、親水性、柔性與催化活性之間的關繫,最後對纖維蛋白水解部位結構進行瞭分析.結果錶明,黃粉蟲纖溶酶的活性中心是組氨痠、絲氨痠和天鼕氨痠三箇氨基痠殘基,位于毬蛋白中心凹穴處,底物結閤部位是絲氨痠、天鼕氨痠和甘氨痠.從微觀分子水平上闡述瞭該類酶水解纖維蛋白的機理是催化精氨痠-賴氨痠肽鍵水解,與報道的纖維蛋白的溶解機理相符.
위료심입연구황분충섬용매적섬용궤리,용생물신식학방법대황분충섬용매진행료삼유결구모의여서렬분석.수선조도료기활성중심,이용Biosun연건적동원모건기술,모의료황분충섬용매적삼유결구;이용Goldkey연건,대황분충섬용매적안기산서렬진행료분석,중점토론료기등전점、친수성、유성여최화활성지간적관계,최후대섬유단백수해부위결구진행료분석.결과표명,황분충섬용매적활성중심시조안산、사안산화천동안산삼개안기산잔기,위우구단백중심요혈처,저물결합부위시사안산、천동안산화감안산.종미관분자수평상천술료해류매수해섬유단백적궤리시최화정안산-뢰안산태건수해,여보도적섬유단백적용해궤리상부.