作物学报
作物學報
작물학보
ACTA AGRONOMICA SINICA
2013年
5期
775-788
,共14页
范虎%文自翔%王春娥%王芳%邢光南%赵团结%盖钧镒
範虎%文自翔%王春娥%王芳%邢光南%趙糰結%蓋鈞鎰
범호%문자상%왕춘아%왕방%형광남%조단결%개균일
野生大豆(Glycine soja Sieb.et Zucc.)%SSR%关联分析%优异等位变异
野生大豆(Glycine soja Sieb.et Zucc.)%SSR%關聯分析%優異等位變異
야생대두(Glycine soja Sieb.et Zucc.)%SSR%관련분석%우이등위변이
Wild soybean (Glycine soja Sieb.et Zucc.)%Simple-sequence repeat (SSR)%Association analysis%Elite allele
选用204对SSR标记对全国野生大豆群体(174份代表性样本)的基因组扫描,采用TASSEL软件的GLM(general linear model)方法对百粒重、开花期、成熟期、干豆腐得率、干豆乳得率和耐淹性性状值关联分析,解析与性状关联位点的优异等位变异,鉴别出一批与农艺、加工性状关联的优异等位变异及携带优异等位变异的载体材料;进一步分析极值表型材料的遗传构成.结果表明:(1)累计51个位点(次)与性状关联,有些标记同时与2个或多个性状相关联,可能是性状相关的遗传基础;关联位点中累计16位点(次)与连锁分析定位的QTL一致;(2)与地方品种群体和育成品种群体的关联位点比较,发现野生群体关联位点只有少数与之相同,群体间育种性状的遗传结构有明显差异.(3)与多性状关联的位点其等位变异对不同性状的效应方向可相同可不同,如GMES5532a-A332对百粒重和耐淹性的相对死苗率都是增效效应,而GMES5532a-A344对百粒重是减效效应,对相对死苗率是增效效应;(4)极值表型材料间的遗传构成有很大差异.表型值大的材料携带较多增效效应大的位点等位变异,例如N23349的百粒重是9.08 g,含有4个增效效应较大的位点等位变异;表型值小的材料携带较多减效效应大的位点等位变异,如N23387的百粒重是0.75 g,含有4个减效效应较大的位点等位变异.关联作图得到的信息可以弥补连锁定位信息的不足,尤其是全基因组位点上复等位变异的信息为育种提供了亲本选配和后代等位条带辅助选择的依据.
選用204對SSR標記對全國野生大豆群體(174份代錶性樣本)的基因組掃描,採用TASSEL軟件的GLM(general linear model)方法對百粒重、開花期、成熟期、榦豆腐得率、榦豆乳得率和耐淹性性狀值關聯分析,解析與性狀關聯位點的優異等位變異,鑒彆齣一批與農藝、加工性狀關聯的優異等位變異及攜帶優異等位變異的載體材料;進一步分析極值錶型材料的遺傳構成.結果錶明:(1)纍計51箇位點(次)與性狀關聯,有些標記同時與2箇或多箇性狀相關聯,可能是性狀相關的遺傳基礎;關聯位點中纍計16位點(次)與連鎖分析定位的QTL一緻;(2)與地方品種群體和育成品種群體的關聯位點比較,髮現野生群體關聯位點隻有少數與之相同,群體間育種性狀的遺傳結構有明顯差異.(3)與多性狀關聯的位點其等位變異對不同性狀的效應方嚮可相同可不同,如GMES5532a-A332對百粒重和耐淹性的相對死苗率都是增效效應,而GMES5532a-A344對百粒重是減效效應,對相對死苗率是增效效應;(4)極值錶型材料間的遺傳構成有很大差異.錶型值大的材料攜帶較多增效效應大的位點等位變異,例如N23349的百粒重是9.08 g,含有4箇增效效應較大的位點等位變異;錶型值小的材料攜帶較多減效效應大的位點等位變異,如N23387的百粒重是0.75 g,含有4箇減效效應較大的位點等位變異.關聯作圖得到的信息可以瀰補連鎖定位信息的不足,尤其是全基因組位點上複等位變異的信息為育種提供瞭親本選配和後代等位條帶輔助選擇的依據.
선용204대SSR표기대전국야생대두군체(174빈대표성양본)적기인조소묘,채용TASSEL연건적GLM(general linear model)방법대백립중、개화기、성숙기、간두부득솔、간두유득솔화내엄성성상치관련분석,해석여성상관련위점적우이등위변이,감별출일비여농예、가공성상관련적우이등위변이급휴대우이등위변이적재체재료;진일보분석겁치표형재료적유전구성.결과표명:(1)루계51개위점(차)여성상관련,유사표기동시여2개혹다개성상상관련,가능시성상상관적유전기출;관련위점중루계16위점(차)여련쇄분석정위적QTL일치;(2)여지방품충군체화육성품충군체적관련위점비교,발현야생군체관련위점지유소수여지상동,군체간육충성상적유전결구유명현차이.(3)여다성상관련적위점기등위변이대불동성상적효응방향가상동가불동,여GMES5532a-A332대백립중화내엄성적상대사묘솔도시증효효응,이GMES5532a-A344대백립중시감효효응,대상대사묘솔시증효효응;(4)겁치표형재료간적유전구성유흔대차이.표형치대적재료휴대교다증효효응대적위점등위변이,례여N23349적백립중시9.08 g,함유4개증효효응교대적위점등위변이;표형치소적재료휴대교다감효효응대적위점등위변이,여N23387적백립중시0.75 g,함유4개감효효응교대적위점등위변이.관련작도득도적신식가이미보련쇄정위신식적불족,우기시전기인조위점상복등위변이적신식위육충제공료친본선배화후대등위조대보조선택적의거.