林业科学
林業科學
임업과학
SCIENTIA SILVAE SINICAE
2013年
9期
52-61
,共10页
李玉岭%周厚君%林二培%黄华宏%徐莉莉%童再康
李玉嶺%週厚君%林二培%黃華宏%徐莉莉%童再康
리옥령%주후군%림이배%황화굉%서리리%동재강
光皮桦%转录因子%SPL基因%单核苷酸多态性
光皮樺%轉錄因子%SPL基因%單覈苷痠多態性
광피화%전록인자%SPL기인%단핵감산다태성
Betula luminifera%transcription factor%SPL genes%single nucleotide polymorphism
Squamosa promoter binding protein like genes(SPLs)对植物开花具有重要的调控作用.基于转录组序列并利用RACE技术从光皮桦中分离获得BlSPL1基因,其cDNA序列全长1 825 bp,包含开放阅读框长1 170 bp,编码389个氨基酸,与桃PpSPL1(EMJ10405)的同源性最高(67％),属于陆地植物SPLs基因家族的group VⅧ分支.表达分析显示BlSPL1在光皮桦芽、雌花、雄花、幼苗中均有表达,在雄花和幼苗中表达量较低,但在芽发育成雌花过程中明显上调,推测其可能对早期的雌花形成起调控作用.同时,从57个不同的光皮桦无性系中克隆BlSPL1的基因组序列,进行单核苷酸多态性(SNP)分析,共检测到98个SNP位点,SNP频率为1/26 bp,多样性指数π为0.007 12.在外显子区域,共检测到28个SNP位点,其中11个为同义突变,17个为错义突变.进一步的连锁不平衡分析显示,随着序列长度的增加,不同光皮桦群体BlSPL1内的SNPs连锁不平衡在基因内部迅速衰退.
Squamosa promoter binding protein like genes(SPLs)對植物開花具有重要的調控作用.基于轉錄組序列併利用RACE技術從光皮樺中分離穫得BlSPL1基因,其cDNA序列全長1 825 bp,包含開放閱讀框長1 170 bp,編碼389箇氨基痠,與桃PpSPL1(EMJ10405)的同源性最高(67％),屬于陸地植物SPLs基因傢族的group VⅧ分支.錶達分析顯示BlSPL1在光皮樺芽、雌花、雄花、幼苗中均有錶達,在雄花和幼苗中錶達量較低,但在芽髮育成雌花過程中明顯上調,推測其可能對早期的雌花形成起調控作用.同時,從57箇不同的光皮樺無性繫中剋隆BlSPL1的基因組序列,進行單覈苷痠多態性(SNP)分析,共檢測到98箇SNP位點,SNP頻率為1/26 bp,多樣性指數π為0.007 12.在外顯子區域,共檢測到28箇SNP位點,其中11箇為同義突變,17箇為錯義突變.進一步的連鎖不平衡分析顯示,隨著序列長度的增加,不同光皮樺群體BlSPL1內的SNPs連鎖不平衡在基因內部迅速衰退.
Squamosa promoter binding protein like genes(SPLs)대식물개화구유중요적조공작용.기우전록조서렬병이용RACE기술종광피화중분리획득BlSPL1기인,기cDNA서렬전장1 825 bp,포함개방열독광장1 170 bp,편마389개안기산,여도PpSPL1(EMJ10405)적동원성최고(67％),속우륙지식물SPLs기인가족적group VⅧ분지.표체분석현시BlSPL1재광피화아、자화、웅화、유묘중균유표체,재웅화화유묘중표체량교저,단재아발육성자화과정중명현상조,추측기가능대조기적자화형성기조공작용.동시,종57개불동적광피화무성계중극륭BlSPL1적기인조서렬,진행단핵감산다태성(SNP)분석,공검측도98개SNP위점,SNP빈솔위1/26 bp,다양성지수π위0.007 12.재외현자구역,공검측도28개SNP위점,기중11개위동의돌변,17개위착의돌변.진일보적련쇄불평형분석현시,수착서렬장도적증가,불동광피화군체BlSPL1내적SNPs련쇄불평형재기인내부신속쇠퇴.
