计算机工程与设计
計算機工程與設計
계산궤공정여설계
COMPUTER ENGINEERING AND DESIGN
2014年
4期
1471-1475
,共5页
基于文献%非负矩阵因子分解%概念特征值%基因功能关系%基因分类
基于文獻%非負矩陣因子分解%概唸特徵值%基因功能關繫%基因分類
기우문헌%비부구진인자분해%개념특정치%기인공능관계%기인분류
literature-based%NMF model%concept features%gene function relations%gene classification
为了充分利用现有的生物医学文献和基因组信息来确定基因之间的功能关系,开发了一个基于Web的生物信息学软件环境,叫做基因功能关系助手(GFRA).该软件使用了非负矩阵因子分解(NMF)的算法,便于发现基因之间的功能关系并根据基因之间的相关程度将其分类.使用3个手动构建的基因文档集合来测试GFRA,准确率达到一定的精度.GFRA实现了从文本流和文本库(如MEDLINE)中挖掘知识,鉴定新基因之间的功能关系,对于验证和分析由微阵列实验提出的基因关联有很大帮助.
為瞭充分利用現有的生物醫學文獻和基因組信息來確定基因之間的功能關繫,開髮瞭一箇基于Web的生物信息學軟件環境,叫做基因功能關繫助手(GFRA).該軟件使用瞭非負矩陣因子分解(NMF)的算法,便于髮現基因之間的功能關繫併根據基因之間的相關程度將其分類.使用3箇手動構建的基因文檔集閤來測試GFRA,準確率達到一定的精度.GFRA實現瞭從文本流和文本庫(如MEDLINE)中挖掘知識,鑒定新基因之間的功能關繫,對于驗證和分析由微陣列實驗提齣的基因關聯有很大幫助.
위료충분이용현유적생물의학문헌화기인조신식래학정기인지간적공능관계,개발료일개기우Web적생물신식학연건배경,규주기인공능관계조수(GFRA).해연건사용료비부구진인자분해(NMF)적산법,편우발현기인지간적공능관계병근거기인지간적상관정도장기분류.사용3개수동구건적기인문당집합래측시GFRA,준학솔체도일정적정도.GFRA실현료종문본류화문본고(여MEDLINE)중알굴지식,감정신기인지간적공능관계,대우험증화분석유미진렬실험제출적기인관련유흔대방조.
