遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2014年
4期
376-386
,共11页
陈先知%王燕%史建磊%朱隆静%王克磊%徐坚
陳先知%王燕%史建磊%硃隆靜%王剋磊%徐堅
진선지%왕연%사건뢰%주륭정%왕극뢰%서견
黄瓜%热激转录因子%生物信息学%耐热性
黃瓜%熱激轉錄因子%生物信息學%耐熱性
황과%열격전록인자%생물신식학%내열성
cucumber%heat shock factors%bioinformatics%heat resistance
热激转录因子(Heat shock factors,HSFs)普遍存在于整个生物界.尽管植物HSFs的DNA结合域具有较高的保守性,但其结构特征、生物功能具有多样化的特点.本文利用黄瓜(Cucumis sativus L.)全基因组测序结果,运用生物信息学方法鉴定了黄瓜HSFs,并对其数量、序列特征、染色体定位以及系统发育关系等进行分析.结果表明,黄瓜至少含有21个HSFs基因家族成员,编码184 ~ 560个氨基酸,分子量21.2~62.3 kDa,等电点(PI)4.70~9.10;序列比对发现这些成员都具有转录因子特有的DNA结合域(DNA binding domain,DBD);染色体定位分析表明,除Csa026480之外,其余HSFs不均匀分布在黄瓜7条染色体上.从拟南芥(Arabidopsis thaliana)和黄瓜HSFs系统发育树可以看出,这些转录因子分为3个分支,其中1分支进一步可分为3类(A、B、C类),系统发育分析揭示黄瓜HSFs蛋白存在9对直系同源蛋白,3对旁系同源蛋白,表明HSF转录因子基因家族的多样化发生在黄瓜和拟南芥分化之前.EST表达分析发现这些热激转录因子参与黄瓜的果实、雌花和两性花的发育与形成;通过qRT-PCR分析,发现这些基因在黄瓜苗期应对高温热激响应中表达水平存在显著的差异.研究结果为进一步分析黄瓜热激转录因子奠定了基础.
熱激轉錄因子(Heat shock factors,HSFs)普遍存在于整箇生物界.儘管植物HSFs的DNA結閤域具有較高的保守性,但其結構特徵、生物功能具有多樣化的特點.本文利用黃瓜(Cucumis sativus L.)全基因組測序結果,運用生物信息學方法鑒定瞭黃瓜HSFs,併對其數量、序列特徵、染色體定位以及繫統髮育關繫等進行分析.結果錶明,黃瓜至少含有21箇HSFs基因傢族成員,編碼184 ~ 560箇氨基痠,分子量21.2~62.3 kDa,等電點(PI)4.70~9.10;序列比對髮現這些成員都具有轉錄因子特有的DNA結閤域(DNA binding domain,DBD);染色體定位分析錶明,除Csa026480之外,其餘HSFs不均勻分佈在黃瓜7條染色體上.從擬南芥(Arabidopsis thaliana)和黃瓜HSFs繫統髮育樹可以看齣,這些轉錄因子分為3箇分支,其中1分支進一步可分為3類(A、B、C類),繫統髮育分析揭示黃瓜HSFs蛋白存在9對直繫同源蛋白,3對徬繫同源蛋白,錶明HSF轉錄因子基因傢族的多樣化髮生在黃瓜和擬南芥分化之前.EST錶達分析髮現這些熱激轉錄因子參與黃瓜的果實、雌花和兩性花的髮育與形成;通過qRT-PCR分析,髮現這些基因在黃瓜苗期應對高溫熱激響應中錶達水平存在顯著的差異.研究結果為進一步分析黃瓜熱激轉錄因子奠定瞭基礎.
열격전록인자(Heat shock factors,HSFs)보편존재우정개생물계.진관식물HSFs적DNA결합역구유교고적보수성,단기결구특정、생물공능구유다양화적특점.본문이용황과(Cucumis sativus L.)전기인조측서결과,운용생물신식학방법감정료황과HSFs,병대기수량、서렬특정、염색체정위이급계통발육관계등진행분석.결과표명,황과지소함유21개HSFs기인가족성원,편마184 ~ 560개안기산,분자량21.2~62.3 kDa,등전점(PI)4.70~9.10;서렬비대발현저사성원도구유전록인자특유적DNA결합역(DNA binding domain,DBD);염색체정위분석표명,제Csa026480지외,기여HSFs불균균분포재황과7조염색체상.종의남개(Arabidopsis thaliana)화황과HSFs계통발육수가이간출,저사전록인자분위3개분지,기중1분지진일보가분위3류(A、B、C류),계통발육분석게시황과HSFs단백존재9대직계동원단백,3대방계동원단백,표명HSF전록인자기인가족적다양화발생재황과화의남개분화지전.EST표체분석발현저사열격전록인자삼여황과적과실、자화화량성화적발육여형성;통과qRT-PCR분석,발현저사기인재황과묘기응대고온열격향응중표체수평존재현저적차이.연구결과위진일보분석황과열격전록인자전정료기출.