CAJ | 학술논문

等位基因的变异在各种生物中都是普遍存在的,并对基因的表达起着重要的调控作用.为了探索关联分析中品种数目(A)、平均等位基因多态信息含量(B)和候选基因总贡献率(C)对候选基因分析结果的影响,本研究采用经验贝叶斯(E-Bayes)方法探讨了上述因素对候选基因检测功效、遗传效应估计值的准确度和精确度以及假阳性出现频率等的影响.结果表明:(1)随着A、B和C的增加,候选基因的检测功效和效应估计值的准确度和精确度明显提高,假阳性出现的频率降低.(2)B对检测功效有显著的影响.在B值保持较高的水平时,即使品种的数目保持较低的水平以及候选基因的总贡献率较低时,平均检测功效也可达到80％;当B值为中等水平时,需要较大品种数目才能使平均统计功效超过80％;当B值较小时,品种数目即使达到100,3种贡献率水平下的统计功效最高也未达到50％.(3)B对候选基因效应估计值的准确度和精确度有显著的影响.随着B的增加,候选基因效应估计的准确度和精确度增加.(4)B因素对假阳性频率也有显著影响.在实例分析中检测到4个基因与稻米糊化温度显著关联.因此,在进行等位基因功能差异的统计遗传学分析时等位基因多态性是主要的影响因素,同时较多的品种数和较高的贡献率对候选基因的统计功效、效应估计值的准确度和精确度也有重要影响.
등위기인적변이재각충생물중도시보편존재적,병대기인적표체기착중요적조공작용.위료탐색관련분석중품충수목(A)、평균등위기인다태신식함량(B)화후선기인총공헌솔(C)대후선기인분석결과적영향,본연구채용경험패협사(E-Bayes)방법탐토료상술인소대후선기인검측공효、유전효응고계치적준학도화정학도이급가양성출현빈솔등적영향.결과표명:(1)수착A、B화C적증가,후선기인적검측공효화효응고계치적준학도화정학도명현제고,가양성출현적빈솔강저.(2)B대검측공효유현저적영향.재B치보지교고적수평시,즉사품충적수목보지교저적수평이급후선기인적총공헌솔교저시,평균검측공효야가체도80％;당B치위중등수평시,수요교대품충수목재능사평균통계공효초과80％;당B치교소시,품충수목즉사체도100,3충공헌솔수평하적통계공효최고야미체도50％.(3)B대후선기인효응고계치적준학도화정학도유현저적영향.수착B적증가,후선기인효응고계적준학도화정학도증가.(4)B인소대가양성빈솔야유현저영향.재실례분석중검측도4개기인여도미호화온도현저관련.인차,재진행등위기인공능차이적통계유전학분석시등위기인다태성시주요적영향인소,동시교다적품충수화교고적공헌솔대후선기인적통계공효、효응고계치적준학도화정학도야유중요영향.