作物学报
作物學報
작물학보
ACTA AGRONOMICA SINICA
2014年
1期
45-53
,共9页
李飞%徐建飞%刘杰%段绍光%卞春松%Jiwan P.PALTA%金黎平
李飛%徐建飛%劉傑%段紹光%卞春鬆%Jiwan P.PALTA%金黎平
리비%서건비%류걸%단소광%변춘송%Jiwan P.PALTA%금려평
马铃薯野生种%耐冻%冷驯化%FAD2%基因表达
馬鈴藷野生種%耐凍%冷馴化%FAD2%基因錶達
마령서야생충%내동%랭순화%FAD2%기인표체
Wild potato species%Frost tolerance%Cold acclimation capacity%FAD2%Gene expression
以3个耐冻性和冷驯化能力不同的马铃薯野生种Solanum commersonii、S.acaule和S.cardiophyllum为材料,利用RT-PCR技术克隆出不饱和脂肪酸合成途径中的关键酶基因ω-6脱氢酶基因(FAD2),分别命名为Cmm-FAD2(GenBank登录号为KF214782)、Aca-FAD2 (KF214781)和Cph-FAD2 (KF214783).序列分析表明,该基因在3个马铃薯野生种中核苷酸长度都为1326 bp,编码441个氨基酸残基.3个野生种FAD2基因核苷酸序列和蛋白序列比对结果表明,在18个位点的差异核苷酸中有8个位点的差异导致对应的氨基酸残基变化,其中第11和第44氨基酸残基处,耐冻且有冷驯化能力的S.commersonii和S.acaule有相同的氨基酸,而冷冻敏感S cardiophyllum的氨基酸却不同.二级结构预测结果表明S.commersonii和S.acaule的FAD2蛋白与S.cardiophyllum FAD2蛋白的α-螺旋、延伸链和随机卷曲存在明显差异.蛋白多序列比对和进化树分析表明,3个马铃薯野生种的FAD2基因与番茄的亲缘关系最近,其次是与马齿笕.qPCR分析表明,12d冷驯化使FAD2基因在3个马铃薯野生种中都上调表达,S.commersonii和S.acaule的FAD2基因表达水平均高于S.cardiophyllum,且差异显著.
以3箇耐凍性和冷馴化能力不同的馬鈴藷野生種Solanum commersonii、S.acaule和S.cardiophyllum為材料,利用RT-PCR技術剋隆齣不飽和脂肪痠閤成途徑中的關鍵酶基因ω-6脫氫酶基因(FAD2),分彆命名為Cmm-FAD2(GenBank登錄號為KF214782)、Aca-FAD2 (KF214781)和Cph-FAD2 (KF214783).序列分析錶明,該基因在3箇馬鈴藷野生種中覈苷痠長度都為1326 bp,編碼441箇氨基痠殘基.3箇野生種FAD2基因覈苷痠序列和蛋白序列比對結果錶明,在18箇位點的差異覈苷痠中有8箇位點的差異導緻對應的氨基痠殘基變化,其中第11和第44氨基痠殘基處,耐凍且有冷馴化能力的S.commersonii和S.acaule有相同的氨基痠,而冷凍敏感S cardiophyllum的氨基痠卻不同.二級結構預測結果錶明S.commersonii和S.acaule的FAD2蛋白與S.cardiophyllum FAD2蛋白的α-螺鏇、延伸鏈和隨機捲麯存在明顯差異.蛋白多序列比對和進化樹分析錶明,3箇馬鈴藷野生種的FAD2基因與番茄的親緣關繫最近,其次是與馬齒筧.qPCR分析錶明,12d冷馴化使FAD2基因在3箇馬鈴藷野生種中都上調錶達,S.commersonii和S.acaule的FAD2基因錶達水平均高于S.cardiophyllum,且差異顯著.
이3개내동성화랭순화능력불동적마령서야생충Solanum commersonii、S.acaule화S.cardiophyllum위재료,이용RT-PCR기술극륭출불포화지방산합성도경중적관건매기인ω-6탈경매기인(FAD2),분별명명위Cmm-FAD2(GenBank등록호위KF214782)、Aca-FAD2 (KF214781)화Cph-FAD2 (KF214783).서렬분석표명,해기인재3개마령서야생충중핵감산장도도위1326 bp,편마441개안기산잔기.3개야생충FAD2기인핵감산서렬화단백서렬비대결과표명,재18개위점적차이핵감산중유8개위점적차이도치대응적안기산잔기변화,기중제11화제44안기산잔기처,내동차유랭순화능력적S.commersonii화S.acaule유상동적안기산,이냉동민감S cardiophyllum적안기산각불동.이급결구예측결과표명S.commersonii화S.acaule적FAD2단백여S.cardiophyllum FAD2단백적α-라선、연신련화수궤권곡존재명현차이.단백다서렬비대화진화수분석표명,3개마령서야생충적FAD2기인여번가적친연관계최근,기차시여마치견.qPCR분석표명,12d랭순화사FAD2기인재3개마령서야생충중도상조표체,S.commersonii화S.acaule적FAD2기인표체수평균고우S.cardiophyllum,차차이현저.
