华中师范大学学报(自然科学版)
華中師範大學學報(自然科學版)
화중사범대학학보(자연과학판)
JOURNAL OF CENTRAL CHINA NORMAL UNIVERSITY(NATURAL SCIENCES)
2014年
2期
251-256
,共6页
芮斌%金杰军%范亚东%文汉
芮斌%金傑軍%範亞東%文漢
예빈%금걸군%범아동%문한
代谢通量平衡分析%代谢通量变化性分析%代谢通量%酶基因
代謝通量平衡分析%代謝通量變化性分析%代謝通量%酶基因
대사통량평형분석%대사통량변화성분석%대사통량%매기인
Flux Blance Analysis(FBA)%Flux Variality Analysis(FVA)%metabolic flux%enzyme gene
大肠杆菌(E.coli)因其遗传信息简单且容易培养而被广泛用作各种生物化学、生物技术研究的模式微生物.为了认识重要模式生物大肠杆菌的代谢系统中各种酶的作用,以软件分析的模式,对已经构建好的小型大肠杆菌代谢系统在cobra中进行代谢通量平衡分析FBA(Flux-Bal-ance Analysis)和代谢通量变化性分析FVA(Flux Variability Analysis),分别单独敲除代谢系统中的25个酶基因,分析敲除各个酶基因后的FBA和FVA的计算结果,通过作图显示出在大肠杆菌代谢系统中不同酶基因被敲除后每个反应的两项结果变化和不同酶基因被敲除后全部反应的两项结果的变化,以此来推测大肠杆菌代谢系统中各种酶所起的作用.
大腸桿菌(E.coli)因其遺傳信息簡單且容易培養而被廣汎用作各種生物化學、生物技術研究的模式微生物.為瞭認識重要模式生物大腸桿菌的代謝繫統中各種酶的作用,以軟件分析的模式,對已經構建好的小型大腸桿菌代謝繫統在cobra中進行代謝通量平衡分析FBA(Flux-Bal-ance Analysis)和代謝通量變化性分析FVA(Flux Variability Analysis),分彆單獨敲除代謝繫統中的25箇酶基因,分析敲除各箇酶基因後的FBA和FVA的計算結果,通過作圖顯示齣在大腸桿菌代謝繫統中不同酶基因被敲除後每箇反應的兩項結果變化和不同酶基因被敲除後全部反應的兩項結果的變化,以此來推測大腸桿菌代謝繫統中各種酶所起的作用.
대장간균(E.coli)인기유전신식간단차용역배양이피엄범용작각충생물화학、생물기술연구적모식미생물.위료인식중요모식생물대장간균적대사계통중각충매적작용,이연건분석적모식,대이경구건호적소형대장간균대사계통재cobra중진행대사통량평형분석FBA(Flux-Bal-ance Analysis)화대사통량변화성분석FVA(Flux Variability Analysis),분별단독고제대사계통중적25개매기인,분석고제각개매기인후적FBA화FVA적계산결과,통과작도현시출재대장간균대사계통중불동매기인피고제후매개반응적량항결과변화화불동매기인피고제후전부반응적량항결과적변화,이차래추측대장간균대사계통중각충매소기적작용.