世界农药
世界農藥
세계농약
Pesticides of world
2014年
2期
27-33,60
,共8页
秦菠%张博%周艳芬%汪小芬%曹振龙%任天瑞%王振山
秦菠%張博%週豔芬%汪小芬%曹振龍%任天瑞%王振山
진파%장박%주염분%왕소분%조진룡%임천서%왕진산
鲫鱼%污染%克隆%模拟
鯽魚%汙染%剋隆%模擬
즉어%오염%극륭%모의
A型γ-氨基丁酸(aminobutyric acid,GABA)是一类配体门控离子通道型受体,亦为脊椎动物和非脊椎动物的中枢神经系统内最主要的抑制性神经递质GABA的受体,其离子通道上存在氟虫腈等杀虫剂的作用靶点,是医药和农药工作者研究的重点.通过RACE-PCR技术成功获取新基因鲫鱼GABAARβ3的全长(GenBank登录号:KC964110).序列分析显示该基因核苷酸序列共2 767 bp,含有1个由502个氨基酸残基组成的开放阅读框,编码蛋白分子量约为56 KD.报道了该基因的生物信息学分析和三维结构模拟及其与氟虫腈作用情况,BLAST结果表明,氨基酸序列与其他已知GABAARβ3基因家族成员间序列相似性介于76%~89%之间,并与其他亚族蛋白基因存在很高的同源性.以线虫体内对阿维菌素敏感的谷氨酸门控氯离子通道受体蛋白的α亚基(PDB ID:3RHW)作为模板,用DS(Discovery Studio)模拟鲫鱼GABAAβ3亚基的同源五聚体结构,优化结构模型,与农药配体分子做分子对接,计算作用模式和结合能力.研究鱼类GABAAR亚基与农药分子的作用.
A型γ-氨基丁痠(aminobutyric acid,GABA)是一類配體門控離子通道型受體,亦為脊椎動物和非脊椎動物的中樞神經繫統內最主要的抑製性神經遞質GABA的受體,其離子通道上存在氟蟲腈等殺蟲劑的作用靶點,是醫藥和農藥工作者研究的重點.通過RACE-PCR技術成功穫取新基因鯽魚GABAARβ3的全長(GenBank登錄號:KC964110).序列分析顯示該基因覈苷痠序列共2 767 bp,含有1箇由502箇氨基痠殘基組成的開放閱讀框,編碼蛋白分子量約為56 KD.報道瞭該基因的生物信息學分析和三維結構模擬及其與氟蟲腈作用情況,BLAST結果錶明,氨基痠序列與其他已知GABAARβ3基因傢族成員間序列相似性介于76%~89%之間,併與其他亞族蛋白基因存在很高的同源性.以線蟲體內對阿維菌素敏感的穀氨痠門控氯離子通道受體蛋白的α亞基(PDB ID:3RHW)作為模闆,用DS(Discovery Studio)模擬鯽魚GABAAβ3亞基的同源五聚體結構,優化結構模型,與農藥配體分子做分子對接,計算作用模式和結閤能力.研究魚類GABAAR亞基與農藥分子的作用.
A형γ-안기정산(aminobutyric acid,GABA)시일류배체문공리자통도형수체,역위척추동물화비척추동물적중추신경계통내최주요적억제성신경체질GABA적수체,기리자통도상존재불충정등살충제적작용파점,시의약화농약공작자연구적중점.통과RACE-PCR기술성공획취신기인즉어GABAARβ3적전장(GenBank등록호:KC964110).서렬분석현시해기인핵감산서렬공2 767 bp,함유1개유502개안기산잔기조성적개방열독광,편마단백분자량약위56 KD.보도료해기인적생물신식학분석화삼유결구모의급기여불충정작용정황,BLAST결과표명,안기산서렬여기타이지GABAARβ3기인가족성원간서렬상사성개우76%~89%지간,병여기타아족단백기인존재흔고적동원성.이선충체내대아유균소민감적곡안산문공록리자통도수체단백적α아기(PDB ID:3RHW)작위모판,용DS(Discovery Studio)모의즉어GABAAβ3아기적동원오취체결구,우화결구모형,여농약배체분자주분자대접,계산작용모식화결합능력.연구어류GABAAR아기여농약분자적작용.